2001年,国务院第95次总理办公会上通过《财政国库管理制度改革方案》及其实施管理办法,明确提出我国将实施全新的预算执行管理方式,建立以国库单一账户体系为基础、以国库集中收付为资金拨付方式的现代财政国库管理制度。在这一制度下,财政国库将直接控制财政资金从预算到使用的整个过程,实现对财政资金的全面管理。而国库集中支付制度改革则是现代财政国库管理制度改革的重要核心,因此国库集中支付制度改革的成败,将对我国现代财政管理体制的发展产生重大影响。经过10多年的发展,我国国库集中支付制度改革基本实现在省（部）市区（县）三级政府全覆盖。国库集中支付制度改革有效地提高了各级政府在财政方面的宏观调控能力,也加强了各级政府在预防贪污腐败方面的防范能力。但尽管如此,在改革实践过程中也发现了不少新的问题,例如:国库部门行政行为合法性受质疑、会计集中核算制度向国库集中支付制度转轨不彻底、财政授权支付比总支付比重偏高、支付审核环节存在不确定因素,多种负面因素的结合使得国库集中支付制度改革来到一个瓶颈期,这些问题处置得当与否将严重影响到国库集中支付制度改革的发展方向。本文通过文献研究法与案例研究法,以深圳市A区为案例进行研究,全面论述深圳市A区国库集中支付制度改革的过程和现状,分析改革当下面临的问题,进一步对改革存在的问题进行梳理和研究,广泛收集来自A区不同预算单位领导、财务主管及业务经办人员的访谈材料,分析当下制约A区国库集中支付制度改革的原因,并从服务、制度与业务的角度提出建议,希望能有效改善当前A区国库集中制度改革所处的困难局面,也为我国国库集中支付制度改革提供区县级案例新参考。