论文部分内容阅读
本研究采用PCR产物直接测序法,对中国五个家驴品种145个样本的序列进行研究,分析中国五个家驴品种的遗传多样性,探讨中国五个家驴品种的起源,为我国家驴种质资源的保护和利用提供理论依据。五个家驴品种分别为关中驴、德州驴、晋南驴、广灵驴和渤海驴。
结果表明:
(1)中国五个家驴品种145条序列中,T、C、A、G四种核苷酸的比例平均为28.3[%]、28.1[%]、31.2[%]及12.4[%]。A+T为59.5[%],G+C为40.5[%],A+T含量高于G+C含量,与哺乳动物线粒体DNA的结构特点相一致。
(2)中国五个家驴品种145条序列,发现32个核苷酸变异位点,37个单倍型,变异类型为转换和颠换,未检测出插入和缺失,其中转换30次,颠换2次,转换率高于颠换率,与哺乳动物核苷酸变异特点一致。
(3)中国五个家驴品种的平均单倍型多样度为0.917±0.011,平均核苷酸多样度为0.02265±0.00040,平均碱基对差异数为9.039±3.055,表明五个家驴品种的遗传多样性水平较高。
(4)引用Genbank已发表的亚洲野驴6条序列,非洲索马里野驴3条序列,克罗地亚驴3条序列,共计12条序列,结合37个单倍型,选用Kimura’s two-parameter模型,构建NJ、UPGMA系统发育树,并绘制了37个单倍型的简约中介网络图。结果显示:中国五个家驴品种分为两大分支,说明中国五个家驴可能有两个母系起源。亚洲野驴的序列未与中国五个家驴品种的序列聚在一起,说明中国五个家驴品种的母系祖先并非亚洲野驴。
(5)中国五个家驴品种的核苷酸分歧度和净遗传距离数值较小,品种两两间差异不明显,五个家驴品种间遗传分化程度不高。