2003年胡锦涛在讲话中提出科学发展观，其中明确提出统筹区域发展。在党的十七大报告中指出，要突破行政区划界限，形成若干带动力强，联系紧密的经济圈和经济带。在“十二五”规划纲要第五篇提出优化格局，促进区域协调发展。但是在地方政府跨区域合作治理中存在一些障碍导致了“咫尺天涯”的悲剧。在区域合作治理中，地方政府总是注重个体发展却常常忽视了整个集体的理性行为而导致集体行动的困境。要增加实现跨区域合作治理的可能性则可通过建立双边或多边的政治协调机制使得地方政府之间能够有良好的沟通从而降低交易费用为目的。本论文主要分为五个部分。第一部分在于给本论文提出一个研究的问题，并对问题的背景做出了分析。通过文献法对问题进行了国内和国外文献的梳理，找到了问题的切入口。本论文主要是以Feiock的Institutional collective Action andEconomic Development Joint Ventures为基础，并在此基础上提出了论文的模型（ICA框架）和假说以及总结了论文的研究方法和技术路线。第二部分重点在于指出了本论文的理论依据（区域合作治理与政治协调机制），但同时还重点阐述本文涉及到的ICA框架下的四个交易成本即信息成本、谈判成本、监督成本以及代理成本结构。接下来论证了区域合作治理的参与者，目标和手段。第三部分首先是对三个样本区域进行了概括和提炼，接着对样本区域的演变做了分析，并对其三个样本区域进行了比较以及归纳了启示。第四部分应对第一章提出模型的政治，经济和社会因素进行分析，并找出ICA框架下的四个交易成本进行相对应的分析，为下一章节的区域合作治理中地方政府的政治协调机制的改进策略做出了充分的论证。同时，第三和第四部分是该论文的中心所在。第五部分首先构建了区域合作治理中地方政府跨界治理的体系，并根据这个跨界的治理体系详细阐述了多内涵的治理手段，多层次的治理空间以及多元化的治理主体。对于多内涵的治理手段，则对应前几章的理论论证和多案例的分析中重点论证的ICA框架的四个交易成本提出了信息共享，平台建设，监督以及激励政策等。第六部分是全文的一个总结。