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目的:检测ARL6IP5基因mRNA和蛋白在缺血性卒中（Ischemic stroke,IS）患者外周单个核细胞（Peripheral blood mononuclear cell,PBMCs）和血浆的表达水平,分析其在卒中后认知障碍（Post-stroke cognitive impairment,PSCI）和卒中后非认知障碍（post-stroke non-cognitive impairment,PSNCI）患者中的表达水平,以及ARL6IP5基因3’-UTR rs7038G/T多态性与IS和PSCI的遗传易感性;分析3’-UTR rs7038G/T多态性的基因型与ARL6IP5基因转录和翻译水平的关系,以期为IS和PSCI预防和诊治提供分子生物学证据。方法:收集川北医学院附属医院IS患者410例（IS组）和健康者239例（健康对照组）为研究对象,其中将部分IS患者根据简易精神状态检查（mini-mental state examination,MMSE）评分分为PSCI组198例和PSNCI组191例,采集其外周静脉血,Ficoll密度梯度离心法分离血浆,Trizol法提取总RNA;实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（Real-time quantitative Polymerase Chain Reaction,RT-qPCR）检测ARL6IP5基因mRNA在PBMCs中的相对表达量;酶联免疫吸附试验（Eazyme linked immunosorbent assay,ELISA）检测ARL6IP5基因蛋白在血浆中的表达水平;限制片段长度多态性聚合酶链反应（Real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,RFLP-PCR）和基因直接测序分型技术检测ARL6IP5基因rs7038G/T等位基因和基因型频率;采用卡方检验或Fisher精确检验对ARL6IP5基因rs7038G/T多态性在各组之间的基因型和等位基因频率进行评估,调整年龄、性别状态后,ARL6IP5基因rs7038G/T多态性基因型与IS风险关系采用多因素Logistic回归进行统计分析,以P<0.05为差异有统计学意义。用比值比（Odds Ratio,OR）和95%可信区间（95%Confidence Intervals,95%CI）分析基因型和等位基因相对危险度。结果:（1）logistic回归分析显示IS组和健康对照组在中性粒细胞百分比、血小板、甘油三脂及肌酐上具有统计学意义（P<0.05）,而两组在白细胞计数、超敏C反应蛋白、同型半胱氨酸及高密度脂蛋白上不具有统计学意义（P>0.05）;多因素logistic回归分析显示,PSCI组和PSNCI组在文化程度、日常生活能力（activities of daily living,ADL）评定及心脏病史上差异具有统计学意义（P<0.05）,在年龄、性别、吸烟史、饮酒史、多发梗塞、TOAST分型、中性粒细胞百分比上无统计学差异（P>0.05）。（2）分别随机选取IS组120例和健康对照组60例进行RT-qPCR及ELISA试验,IS组mRNA相对表达量为1.3382±1.2166,健康对照组为1.9863±1.4679,差异具有统计学意义（P=0.001）,PSCI组mRNA相对表达量为1.6991±1.4210,PSNCI组为1.0914±0.9904,差异具有统计学意义（P=0.004）;IS组血浆蛋白表达量为3.7298±1.3441,健康对照组为2.7057±1.0141,差异具有统计学意义（P=0.001）,PSCI组血浆蛋白表达量为3.3340±1.4727,PSNCI组为4.0597±1.1494,差异具有统计学意义（P=0.045）。（3）分析410例IS组和239例健康对照组ARL6IP5基因rs7038G/T单核苷酸多态性分型。健康对照组采用拟合度χ2检验进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验,结果提示P=0.064,健康对照组人群rs7038G/T碱基分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡,具有良好的群体代表性。ARL6IP5基因rs7038G/T多态位点的等位基因在IS组及健康对照组的频率分布具有显著的差异。rs7038G/T多态位点在IS组及健康对照组中T等位基因频率分别为60.4%和70.3%,G等位基因频率39.6%和29.7%。rs7038G/T多态位点G等位基因健康对照组中的频率显著低于IS组（P<0.0001,OR=0.64,95%CI=0.52–0.82）。采用共显性遗传模型（异质模型和同质模型）、显性遗传模型和隐性遗传模型分析ARL6IP5基因rs7038G/T多态位点基因型与IS风险关系。在共显性模型中,rs7038G/T多态位点的TT、TG、GG基因型频率在IS组和健康对照组分别为31.2%、58.3%、10.5%和46.9%、46.9%、6.2%,基因型频率之间具有显著的统计学差异（异质模型:P<0.0001,OR=0.54,95%CI=0.38-0.75;同质模型:P=0.005,OR=0.40,95%CI=0.21-0.76）。在显性模型中,差异具有统计学意义（P<0.0001,OR=0.52,95%CI=0.37-0.72）。在隐性模式中不具有统计学差异（P=0.70,OR=0.57,95%CI=0.31-1.05）;对年龄和性别进行调整后进行多因素回归分析得到类似结果。ARL6IP5基因rs7038G/T多态性位点在PSCI组及PSNCI组中G等位基因频率分别为40.16%和39.27%,rs7038G/T多态性位点G等位基因在PSCI组中的频率与PSNCI组之间无统计学差异（P=0.83,OR=0.96,95%CI=0.72-1.28）。在共显性模型中,rs7038G/T多态性位点的TT、TG、GG基因型频率在PSCI组和PSNCI组分别为31.31%、57.1%、11.6%和30.9%、59.7%、9.4%,基因型频率之间无统计学差异（异质模型P=0.80,OR=1.06,95%CI=0.68-1.65;同质模型P=0.59,OR=0.82,95%CI=0.4-1.68）。在显性模型中,与TT基因型相比较,TG/GG基因型与PSCI的发病无关（P=0.93,OR=1.02,95%CI=0.66-1.57）。在隐形模型中,与TG/GG基因型相比,GG基因型与PSCI发病无关（P=0.48,OR=0.79,95%CI=0.41-1.52）。经过调整年龄和性别后,多因素Logistic回归分析得到类似结果。分层分析显示,IS组在杂合子模式下人口学特征及部分临床资料不具有统计学差异（P>0.05）,在纯合子模式下显示甘油三脂分层分析具有统计学意义（P<0.01）,其余分层分析不具有统计学差异（P>0.05）。PSCI组杂合子模式下人口学特征及部分临床资料在PSCI组不具有统计学差异（P>0.05）,在纯合子模式下PSCI组在甘油三脂分层分析具有统计学意义（P<0.01）,在性别分层上具有统计学意义（P=0.009）,其余分层分析不具有统计学差异（P>0.05）。（4）通过分析健康对照组ARL6IP5基因rs7038G/T多态性基因型与其mRNA和蛋白之间的关系来评价ARL6IP5基因rs7038G/T多态性的生物学功能与IS的关系,统计分析结果表明ARL6IP5基因rs7038G/T多态性TT、GG、TG和TG/GG基因型与ARL6IP5基因mRNA和蛋白之间在健康对照组无统计学差异（P>0.05）,IS组、PSCI组和PSNCI组也得到类似结果。结论:（1）多因素分析提示中性粒细胞百分比、血小板、甘油三脂、肌酐与IS的发病相关;而文化程度、ADL及心脏病史可能与PSCI发病相关。（2）ARL6IP5基因mRNA和蛋白可能参与IS和PSCI的病理生理过程。（3）ARL6IP5基因rs7038G/T多态性可能与IS的遗传易感性有关,G等位基因及GG基因型可能是IS保护因素,其可能与甘油三脂共同作用,但不受年龄、性别、中性粒细胞百分比、超敏C反应蛋白、尿酸等因素的影响;rs7038G/T多态性可能与PSCI的遗传易感性无关。（4）rs7038G/T多态性基因型不引起ARL6IP5基因转录和翻译水平的变化。