从广义上讲,可以将1927年“清党”之后国民党所进行的一系列整理党务的举措都看作是国民党的党务整理。据此,可以将国民党上海市党务整理分为三个时期,即“清党”时期的上海党务整理、中央特委会时期的上海党务整理和二届四中全会之后的上海党务整理。国民党上海特别市党部前身是1924年1月国民党“一大”后成立的国民党上海执行部。西山会议后,西山会议派控制了上海执行部,成立上海“中央”,上海市的国民党党员也分裂为支持广州中央和上海“中央”的两大阵营,彼此之间冲突不断。鉴于上海执行部已被上海伪“中央”控制,失去了存在的意义,1926年1月国民党“二大”决定撤销上海执行部,成立上海市党部,负责领导上海党务工作。新成立的上海市党部始终受国民党左派的控制,并在北伐军占领上海后控制了上海市临时市政府。鉴于上海市的重要地位和上海市党部的左倾倾向,蒋介石遂调集军队,实行“清党”,改组上海市党部。因“清党”对上海市党部破坏严重,故决定对上海市党务进行重新整理。“四一二”时期的党务整理并没有取得预计的效果,反而使得大批贪官污吏、土豪劣绅趁机混入党内,对国民党自身造成了巨大的破坏。随着局势的日趋紧张,党务整理也最终不了了之。随着蒋介石的下野和宁汉合流,西山会议派占主导的中央特别委员会成立,并改组了上海市党部。新成立的上海市党部虽制定公布了一系列整理党务的措施,但都因党部内矛盾重重和缺乏资金而难以推行,党务工作陷入停滞。1928年2月,国民党召开二届四中全会,蒋介石重掌大权,向各地派出省(特别市)党务指导委员,重新进行党务整理。此次党务整理由组织党员总审查和总登记,重建上海市党部基层组织,开展党员训练等多方面组成,至1929年2月产生正式的上海市党部执行委员会,党务整理宣告基本完成。经过三次党务整理,上海市党部党员在数量上大幅减少,在党员的构成上,以青年学生为主,他们大多年纪较轻,经济条件一般,在大革命时期加入国民党。在组织上,通过党务整理,CC系得以控制上海市党部,这种控制在之后仍不断得到强化。在思想上,一方面,从开始“清党”到党务整理结束,蒋系势力始终牢牢控制着上海市党部；另一方面,即使在经过“清党”之后,上海市基层党部仍然十分激进。但这种激进并未改变党部对蒋介石的拥护态度,即在“拥蒋”的同时不失激进,以上就是党务整理后国民党上海市党部的基本情况。