我国农村农业生产迅速发展,产生的农药、化肥、畜禽粪便以及固体废弃物数量急剧增加,农业面源污染日益严重,对农村生态环境造成严重的破坏,严重威胁着人类健康,使农村自然资源、生态环境与可持续发展之间的矛盾日益突出。现阶段面源污染造成的生态与环境问题已经成为农村经济、社会可持续发展的制约因素,寻求控制农业面源污染的有效途径已成为解决农村环境污染问题的首要任务。本文以生态经济学和可持续发展理论为基础,采用定性分析与定量分析相结合的研究方法,首先分析了面源污染控制和生态补偿的国内外研究现状,接着以衡阳市为例,根据衡阳市2009年农业生产相关数据,利用量化计算方法,研究了衡阳市下辖各县区的农业面源污染现状和特征,集中讨论了化肥、农药、农用薄膜、禽畜粪便、生活废水等因素导致的面源污染,并分析了衡阳市农业面源污染的控制现状。接下来,文章探讨了生态补偿机制与政策措施,对农业面源污染控制的生态补偿主体与客体、补偿原则、补偿方式及影响生态补偿的相关因素进行了具体的分析,并针对衡阳农村面源污染的现状及其它的实际情况,尝试构建了农业面源污染控制的生态补偿机制,并提出生态补偿的对策。本文主体分为六章,第一章主要介绍本文的研究意义与背景、国内外相关的研究现状、研究方法和技术路线；第二章主要介绍农业面源污染相关概念,并对面源污染的生态经济学和可持续发展理论进行分析,包括农业生态环境的公共物品性质、农业面源污染的外部不经济性分析；第三章主要通过对衡阳市各地区的种植业、养殖业以及农村生活废水的污染源数据进行统计,分析了当前衡阳市各地区农业面源污染的现状；第四章阐述生态补偿机制与政策措施,对农业面源污染控制的生态补偿对象、生态补偿原则、生态补偿方式及方式的选取进行分析,分别从资金补偿、政策补偿、项目补偿、技术补偿和其他补偿等方面交叉构建衡阳市农业面源污染控制的生态补偿机制；第五章为结论部分,主要取得以下研究结论：(1)化肥污染是水体面源污染的主要原因,其中氮肥和钾肥贡献率最大；(2)衡阳农业面源污染主要以化肥、农药和养殖业禽畜粪便产生的污染为主,污染较严重,对农业生态环境构成了极大的压力。衡阳市禽畜粪便总体对环境影响较严重,极个别地区的禽畜粪便负荷已对环境构成极大的威胁。(3)衡阳农村经济发展较落后,经济基础薄弱,要保护农业生态环境,急需政府采用生态补偿资金以及生态补偿机制的方式介入,改变农户传统的生产方式,以减少对农业生态环境的破坏,采用可持续发展的生产方式,使农业生态环境的正外部性内部化。(4)在衡阳地区应主要采取资金补偿的方式,不同的产业应用不同的补偿组合方式,应用技术补偿、政策补偿、项目补偿、实物补偿等多种方式,发挥各自的优势,取长补短,达到生态补偿的最终目的。