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狗牙根,也叫百慕大草,是世界三大暖季型草坪草之一,也是一种优良牧草。狗牙根分布广泛,遗传差异大,我国拥有丰富的野生狗牙根资源。本研究以中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所保存的565份野生狗牙根资源为原始材料,先对狗牙根核心种质的构建策略进行筛选,再基于其表型数据和SSR、SCoT两种分子标记数据构建狗牙根核心种质,为狗牙根更深一步的研究做基础铺垫。主要研究结果如下:(1)分别利用狗牙根表型和分子标记数据对核心种质构建策略进行了筛选,筛选内容包括3种取样方法、7种总体取样比例、3种组内取样比例、分别适合表型与分子标记数据的6种聚类方法、适合表型数据的3种遗传距离以及适合分子标记数据的4种遗传距离。筛选最终结果如下,3种取样方法中多次聚类优先取样法最优,7种总体取样比例中选择20%,组内取样比例选择平方根比例。表型数据的几种聚类方法差异不显著,选择常用的不加权类平均法;适合分子标记数据的聚类方法为重心法。不同的遗传距离对表型和分子数据构建核心种质的过程影响差异均不显著,选择常用的马氏距离作为表型遗传距离,选择常用的Neiand Li距离作为分子标记遗传距离。(2)利用上述构建策略基于狗牙根的表型数据构建了狗牙根的第一份核心种质PCore,PCore包含了 108份狗牙根材料,先用均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率和变异系数变化率4个参数对PCore进行评价,再对PCore进行表型性状相关分析和主成分分析,结果表明PCore良好的保留了原始种质的表型遗传多样性、表型性状相关性和群体表型遗传结构。(3)利用狗牙根的SSR分子标记数据构建了狗牙根的第二份核心种质SSRCore,SSRCore包含了 110份狗牙根材料,用SSRCore在平均观测等位基因数、平均有效等位基因数、平均Nei’s遗传多样性指数、平均shannon-weaver指数和多态位点百分率5个参数上的保留比例对SSRCore进行评价,并对其进行主成分分析,结果表明SSRCore能良好保留原始种质SSR分子标记遗传多样性和群体遗传结构。(4)利用狗牙根的SCoT分子标记数据构建了狗牙根的第三份核心种质SCoTCore,SCoTCore包含了 110份狗牙根材料,SCoTCore的评价方法同SSRCore,结果表明SCoTCore能良好保留原始种质基于SCoT分子标记的遗传多样性和遗传结构。(5)综合利用狗牙根的表型、SSR、SCoT三种数据构建了狗牙根的第四份核心种质PMCore,PMCore包含了 104份狗牙根材料。对PMCore进行表型、分子标记两方面的评价,结果表明PMCore在表型、分子标记两方面都能良好保留原始种质的遗传多样性和遗传结构。(6)对PCore、SSRCore、SCoTCore和PMCore 4份核心种质进行表型和分子标记两方面的对比。在保留原始种质分子标记遗传多样性上,4份核心种质都保留得很好,SSRCore和SCoTCore略微优于PCore和PMCore;在保留原始种质表型遗传多样性上,PCore 和 PMCore 远远优于 SSRCore 和 SCoTCore。综合比较,PCore、PMCore比SSRCore、SCoTCore更能同时保留原始种质表型和分子标记两方面的遗传多样性。PCore、PMCore在表型、分子两方面的表现都很相似,难以比较孰优孰劣。鉴于PMCore是整合了狗牙根分子、表型两类数据构建的综合核心种质,因此最终在两者中选择PMCore作为狗牙根的最优核心种质。