论文部分内容阅读
本文通过线粒体COI基因片段、16S rRNA基因片段序列和微卫星标记分别分析四角蛤蜊、西施舌两种帘蛤科海洋贝类以及大黄鱼的群体遗传特性。为四角蛤蜊、西施舌和大黄鱼的系统发育研究、种质资源调查、遗传多样性的保护以及品系培育和品种改良提供分子生物学依据。对南通(NT)和连云港(LYG)的四角蛤蜊(Mactra veneriformis)的COI序列进行PCR扩增、测序和序列分析。序列分析结果表明,两群体49个序列中检测到32个单倍型,50个变异位点。两群体的单倍型多样性分别为0.978(NT)和0.897(LYG),两群体均具有较丰富的遗传多样性,且南通群体比连云港群体更丰富。与GenBank中已发表的四角蛤蜊序列(no.AY874531,AB040846)相似性均大于90%,与中国蛤蜊(M.chinensis)的遗传距离为0.16。线粒体COI序列的比对结果与传统的形态学分类结果一致。对3个群体23个个体(江苏南通NT、福建长乐CL、山东即墨JM)的西施舌16S rRNA进行PCR扩增、测序分析。所得序列比对后为446 bp,G+C含量为41%,32个变异位点。通过NJ树以及序列变异可以看出,长乐群体的遗传结构明显与另两群体不同。利用生物素—磁珠吸附微卫星富集法(FIASCO),筛选西施舌(Coelomactra antiquata)微卫星分子标记。获得含有重复次数不少于5次的微卫星序列38个。其中完美型占68.4%,非完美型占26.3%,混合型占5.3%。除探针中使用的CA和GA两种重复外,还得到ATTG、CGTG、TGTTG的重复序列。微卫星重复次数主要集中在5-46次,最高为70次。并用38个序列设计引物,经PCR筛选,共得到14对引物可扩增出目的片段。为西施舌的微卫星分子标记的应用研究奠定基础。对3个群体共65个个体(江苏28个、浙江18个、福建19个)的COI序列进行扩增、测序和序列分析。序列分析结果表明,比对后625 bp的序列中仅得到18个变异位点,大黄鱼COI序列中A+T含量与G+C相当,单倍型比例较少,江苏野生群体的遗传多样性明显高于福建养殖群体,浙江养殖群体遗传多样性居中。