白灵侧耳结实相关基因的克隆及表达分析

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:shize
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白灵侧耳(Pleurotus eryngii var. tuoliensis C.J. Mou)营养丰富、药用价值高,深受人们喜爱,但由于生长周期长、菇蕾发育同步性差、畸形菇严重,致使栽培经济效益较低,严重影响了其产业发展。因此培育原基发生早、原基发生整齐的新品种已成当务之急。在传统育种的基础上结合并发挥分子育种的优势加快育种进度成为必然。阐明白灵侧耳结实的分子机理是开展分子辅助育种首要解决的问题,而结实分子机理研究的第一步就是寻找与其结实相关的关键基因。本研究以白灵侧耳菌丝和原基为材料,利用LiCl沉淀法对两阶段的RNA进行提取并纯化,然后利用3条锚定引物和26条随机引物组成的78个引物组合对两个发育阶段cDNA进行差异显示PCR扩增,并用非变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对两发育阶段的差异片段进行筛选,对获得的差异片段进行切胶回收并纯化,将纯化片段克隆测序后重新设计引物,并以beta-actin基因为内参基因,采用半定量PCR的方法验证差异片段的真实性,最后应用生物信息学方法对真实的差异片段进行同源性分析并对基因功能进行预测。引物筛选结果表明,78个引物组合中,锚定引物H-T11A组成的引物对扩增出的差异条带最多,效果最好,其余两个效果较差。结实相关基因片段克隆及序列分析结果显示,在菌丝和原基两个发育阶段中最终共获得8条差异片段,差异条带大小多在200-500bp之间。1条与未知蛋白具有40%氨基酸同源性的基因片段在菌丝中高表达,其余7条在原基中高表达,7条片段经同源性分析得知分别与细胞色素P450、糖基转移酶、扩展蛋白、糖苷水解酶家族3、核糖体蛋白L29、高半胱氨酸甲基转移酶、未知蛋白的氨基酸同源性为63%、32%、88%、38%、83%、45%、34%。这些差异片段涉及能量代谢、糖代谢、细胞壁修复与重建、活性氧及蛋白质合成等细胞代谢途径。差异基因的获得为食用菌结实机理的研究及食用菌育种奠定了基础。
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