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创新是引领发展的第一动力,提高创新效率进而提高创新产出,实现创新发展,是现阶段我国医药制造企业的现实选择。本文首先依据创新效率相关理论、前人研究基础及医药制造企业创新活动中阶段性和资源共享性的实际情况,构建医药制造企业共享投入型创新活动系统。其次,依据医药制造企业共享投入型创新活动系统选择共享投入两阶段关联DEA模型,构建评价指标体系。然后,分别从静态和动态角度对我国88家上市医药制造企业创新效率、技术研发阶段效率和成果转化阶段效率进行测算和分析。研究得出:在投入产出存在滞后的假设下,我国上市医药制