在当今经济全球化和竞争日益激烈的市场环境中,高新技术企业必须加大研发投入维持研发创新能力,以新技术、新产品面对激烈的市场竞争,才能在“顾客就是上帝”的经济环境中持续增长或稳定发展。而新三板挂牌的高新技术企业往往是刚起步的中小微企业,人才和技术储备有限,研发资金不足,为此,政府会通过有效的干预手段诱导高新技术企业加大研发投入力度,以提升企业的核心竞争力和持续成长能力,其中研发补助就是政策工具之一。那么,政府研发补助政策在实际执行中是否实现了预期的政策目标呢?换言之,研发补助是否促使企业加大了研发投入力度?而加大研发投入是否提升了企业绩效?研发补助对研发投入和企业绩效两者的关系是否有调节作用?基于此,研究研发补助、研发投入和企业绩效三者之间的关系就具有重要的现实意义和理论价值。因此,针对上述问题,本文以新三板2014年1月集中挂牌的254家高新技术企业为样本,收集其2012—2015年4年的面板数据,首先从描述性分析入手,初步统计不同年度下研发补助、研发投入和企业绩效的走势和差异性。接着,结合外部性理论、信息不对称理论、技术创新理论等相关理论,完成变量定义和模型设定并通过构建固定效益模型进行实证分析,并得出以下结论:挂牌高新技术企业的研发补助正向促进其加大当期研发投入,显著激发了挂牌企业的研发投入热情,但该激励效应不具备持续性,即研发补助不存在滞后作用。挂牌高新技术企业当期的研发投入对企业绩效具有持续性影响,即当期的研发投入产生了挤出效应,反向影响当期的企业绩效;滞后1期的研发投入却产生了激励效应,正向提升了企业绩效。对于挂牌高新技术企业,其研发补助对研发投入与企业绩效的关系起到正向调节作用,即在挂牌企业研发补助增收的带动下,挂牌企业增加研发投入,从而促进绩效显著提升;且滞后1期的研发补助作为调节因子,仍显著地促进了滞后1期的研发投入更快地提升企业绩效。基于以上结论,本文分别从宏观和微观两个角度提出以下政策建议:基于宏观角度,第一,我国应积极完善新三板协议、做市和集合竞价的多元化资本融资方式,并继续推进私募基金的建设,从而基于新三板开拓挂牌高新技术企业融资渠道,激发其研发投入热情。第二,完善审批制度,使研发补助申请流程更高效、更透明。第三,积极推进研发后补助政策,降低政府研发项目的验收成本,营造“先创新,后扶持”的科技研发补助的新潮流。第四,营造阳光健康的政府监管环境,增强挂牌高新技术企业对研发补助政策的信任。基于微观角度,一方面,挂牌高新技术企业应建立研发补助专项资金管理制度,高效支配资金。另一方面,挂牌高新技术企业应保持居安思危的意识,坚持研发创新。