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猪流行性腹泻（Porcine epidemic diarrhea,PED）主要是由猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）引起猪的一种高度接触性肠道传染病,其特征为呕吐、腹泻和脱水,可发生于各年龄段的猪,症状轻重因年龄大小而异,年龄越小,症状越重,死亡率越高。20世纪80年代初我国陆续发生PED,在采取疫苗免疫的基础上,有效地减少了PED发生。然而,自2010年10月以来,新一轮PED疫情在我国70%以上猪场暴发,小猪死亡率超过80%,严重危害了养猪业的发展。众多研究结果表明,PEDV毒株突变频繁发生,从而导致临床上经典毒株疫苗的免疫不确实或免疫失败。为了解和掌握某集团公司猪群中PEDV的临床感染情况以及流行毒株特征,本试验针对该集团公司2017-2020年的腹泻病猪样品,开展了PEDV的检测分析工作,其目的是为制定切实可行的防控策略、合理选择效果确切的免疫疫苗、有效践行PED的防制措施提供科学依据和技术支撑。本试验针对某集团公司2017-2020年的腹泻病猪进行病料采集,共计2261份,其中2017年330份,2018年1001份,2019年798份,2020年132份,涉及病料组织（小肠）1678份、血清329份、粪便193份、肛拭子61份。首先通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）检测,确定猪群中PEDV的感染情况;其次按不同年份和不同猪场,应用RT-PCR对PEDV检测阳性样品进行S基因扩增与测序,分析PEDV流行毒株的同源性;最后利用PEDV检测阳性样品与经典毒株CV777的S基因构建系统进化树,比较亲缘关系。结果显示:（1）在2017-2020年受检的2261份样品中,检出PEDV有980份,总阳性率为43.34%。其中2017年阳性率为53.33%（176/330份）,2018年阳性率为33.57%（336/1001份）,2019年阳性率为45.49%（363/798份）,2020年阳性率为79.55%（105/132份）。病料组织（小肠）、粪便、肛拭子的阳性检出率分别为51.55%（865/1678份）、39.9%（77/193份）和54.1%（33/61份）,差异不显著（P>0.05）;血清样品的阳性检出率最低,为1.52%（5/329份）。（2）114份PEDV阳性样品的S基因之间的核苷酸相似度为88.4%-99.2%,其中2017年来自18个猪场的18份样品之间的为95.6%-98.1%;2018年来自39个猪场的39份样品之间的为95.4%-99.0%;2019年来自21个猪场的21份样品之间的为88.4%-97.9%;2020年来自36个猪场的36份样品之间的为88.4%-99.2%。114份PEDV阳性样品的S基因与经典毒株CV777之间的核苷酸相似度为87.7%-95.4%,其中2017年的为88.8%-90.5%%;2018年的为88.4%-91.1%;2019年的为87.7%-95.4%;2020年的为90.0%-94.2%。（3）114份PEDV阳性样品的S基因分布于两大分支,其中20份与经典毒株CV777处于同一个大的分支,94份处于另一个大的分支。而2017年的18份、2018年的39份样品的S基因与经典毒株CV777均不处于同一个大分支,且相互间分布在不同的小分支上;2019年的21份中的3份、2020年的36份中的19份样品的S基因虽与经典毒株CV777处于同一个大的分支,但其余样品均处于另外的分支,且相互间也分布在不同的小分支上。结果表明:（1）PEDV是引起某集团公司猪群腹泻的主要病原,以2020年的感染率最高,病料组织（小肠）、粪便、肛拭子的阳性检出率最高,血清检出率较低。（2）某集团公司猪群中PEDV流行毒株之间、与经典毒株CV777之间的S基因核苷酸序列相似度变化幅度较大,同源性较低,亲缘关系较远,流行的PEDV遗传变异多见,毒株类型多样化。