观光木(Tsoongiodendron odorum Chun)是我国特有的古老孑遗树种,对研究古代植物区系,古地理,古气候都有重要的科学价值,为国家二级重点保护植物,但是目前该种群处于衰退之中,面临着灭绝的危险。因此,对观光木的保护和研究显得尤为重要和迫切。本研究使用ISSR分子标记技术研究观光木种群的遗传多样性,从分子水平上揭示观光木种群的遗传特性,为观光木的保护和研究提供一定的理论基础。　　 本文针对观光木DNA提取的困难,对传统CTAB提取法进行改良,得到了提取高质量DNA的方法。该方法提取的DNA质量高、杂质少,达到了ISSR分子标记对模板DNA纯度和浓度的要求。　　 使用单因素筛选和均匀设计试验建立并优化了观光木ISSR-PCR的最佳反应体系,即在20μL扩增体系中包括:21xl,10×PCR Buffer、40ng DNA、1U Taq DNA聚合酶、1.6μL Mg2+(2.0mmol/L)、1.6μL dNTPs(0.20mmol/L)、0.61μL primer(0.6μmol/L)、最后ddH2O补足20μL。　　 扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性lmin,53℃退火30s,72℃延伸90s,进行35个循环,最后72℃延伸7min,4℃保存。　　 根据最佳反应体系和扩增程序,从100条ISSR引物中筛选出8条多态性好、扩增稳定的ISSR引物,106份供材料共扩增出121条条带,其中109条呈现多态性条带,多态位点百分率达90.08％。扩增片段从250bp-2000bp,平均每个引物扩增出15条片段。说明观光木种群间存在着丰富的遗传多样性。通过软件分析得到:观光木种群间的He=0.3557,I=0.5276,Gst=0.6480,而种群内的He=0.1261,I=0.1939,说明观光木种群间的遗传多样性是观光木遗传变异的主要来源。　　 基于相似系数和遗传距离得到观光木种群的聚类图谱,将10个观光木种群分为三个大的类群。其中江西九连山保护区和湖南新宁的种群亲缘关系较近,湖南省植物园与湖南省林科大的种群亲缘关系较近,海南省五指山与其它种群的亲缘关系较远独自分为一类。聚类图的构建为观光木种质资源的鉴定和分类具有一定的指导意义。