番茄胞嘧啶甲基转移酶同源基因SlMET1的功能初探

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真核生物中,DNA甲基化是表观遗传学修饰的重要手段之一,DNA甲基转移酶的功能则是在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶第5位碳原子上共价结合一个甲基基团,从而调控对应基因的表达。DNA METHYLTRANSFERASE1 (MET1)作为一种重要的DNA甲基转移酶,影响着整个基因组的甲基化水平。研究表明,拟南芥Atmet1突变体在孢子体时期有多向形态学缺陷,包括开花延迟、畸形胚胎和种子不育,这些都是由于生殖细胞中的低甲基化导致的:在水稻中,破坏OsMET1-2基因会导致一系列水稻生长发育的缺陷。同时MET1蛋白家族在多数真核生物中是保守的,由此可见MET1对植物生长发育有着至关重要的作用。本课题组以及前人的研究发现紫外损伤DNA结合蛋白(DDB1)以表观遗传的方式调控细胞分裂、果实发育以及叶片光和色素的代谢合成。其中研究表明CUL4-DDB1 E3连接酶可以通过组蛋白甲基化作用来调节DNA甲基化。本研究通过生物番茄数据库(Sol Genomics Network, SGN)找到与拟南芥胞嘧啶甲基转移酶MET1同源性较高的序列,即番茄SlMET1。通过分子生物学技术克隆该基因并将其构建为植物过量表达载体pBI121::SlMET1,通过农杆菌介导法,将SlMET1基因导入野生型番茄基因组中,筛选得到稳定的过量表达转基因阳性植株,将其作为遗传材料研究SlMET1基因的功能。同时分析SlMET1在番茄中的表达模式,同时构建绿色荧光瞬时表达载体pART27::SlMET1-GFP,通过农杆菌介导烟草瞬时表达系统进行亚细胞定位实验,确定SlMET1在细胞中的表达位置;在该系统中共同表达SlMET1与DDB1,研究SlMET1与DDB1间的相互关系。研究结果表明,实时定量PCR分析SlMET1基因在野生型番茄果实和植株的各个时期和组织中都有表达;其中,叶片和花中表达量较高,在果实的变色期和红果时期表达量较低。通过绿色荧光融合蛋白载体的表达,确定SlMET1基因只在番茄细胞核中表达。通过免疫共沉淀分析,确定SlMET1和DDB1之间存在相互作用。本研究为研究DDB1以表观遗传学的方式调控植物生长发育过程奠定了理论基础。
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