DPO-qPCR法检测非小细胞肺癌组织及血浆中表皮生长因子受体基因突变的研究

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目的:非小细胞肺癌中EGFR基因突变与酪氨酸激酶抑制剂靶向药物的疗效密切相关,我们试图应用先进的生物技术建立一种新方法,能够在有限的肿瘤标本中快速,准确且灵敏地检测EGFR的基因突变。方法:我们研究了一种双退火引物荧光定量PCR法(DPO-qPCR法),来对非小细胞肺癌病人组织或血浆标本的EGFR基因常见突变进行检测。位于19外显子的DelE746-A750微缺失突变和21外显子的L858R点突变与酪氨酸激酶抑制剂类药物的敏感性相关,我们分别针对这两个常见突变设计了DPO引物并对182个临床样本进行检测,最后我们还将DPO-qPCR法,直接测序法和突变富集PCR三种方法的检测结果进行了比较。结果:通过细胞系梯度稀释模板,我们检测出19外显子DelE746-A750微缺失突变和21外显子L858R点突变检测的DPO引物分别能够检测到低至0.78%和0.025%的野生型背景里的突变型模板(经过计算,分别折合为78和2.5拷贝突变等位基因):我们在182个临床样品中共检测到52例突变,突变率为28.57%。与现有的其他检测方法突变率较一致。其中有4例标本仅在DPO引物中检测为阳性,10例标本仅在ME-PCR中检测为阳性。我们在154个晚期标本中共检测到51例突变,28个早期标本中共检测到1例突变,突变率分别为33.12%和3.57%.结论:该基于荧光定量PCR的改良型双退火引物检测系统DPO-qPCR可以用于临床EGFR基因突变的检测和验证,在对非小细胞肺癌患者的EGFR常见突变临床检测方面具有一定的应用前景。
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