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十字花科黑腐病菌能在全球范围内的许多单子叶和双子叶植物等重要经济作物上引起一系列疾病。在植物组织中的成功侵染和增殖取决于分泌的粘附素、多糖、LPS、降解酶等致病因子。其中一种重要的致病因子就是由hrp基因编码的T3SS,它能够注射许多效应物蛋白到植物细胞内从而引起疾病。Hrp基因在植物病原菌中是保守的,在十字花科黑腐病中hrp基因的表达是受Hrpx调控的,而hrpX受HrpG的调控,除了hrpG和zur,还没有鉴定出其它正向调控hrpX的基因,同时,在hrpG是受哪个基因的调控目前也是未知的,所以,能够鉴定出能够正向调控hrpG、hrpX的基因,有助于揭示植物病原菌的调控机制。
本研究以十字花科黑腐病菌MXB002菌株为研究对象,Tn5插入到XC1510与XC1511之间的非编码片段,命名为xb002,利用RT-PCR的方法确定xb002基因与XC1511之间为共转录关系;通过Fusion PCR的方法,发现将xb002移码突变后仍然可以将MXB002的致病力补回,初步判断xb002是以RNA的形式发挥作用而不是蛋白质;将报告质粒pL6sacBhrpG、pL6sacBhrpX三亲导入MXB002、013B01,结果显示xb002、XC1511正向调控hrpG和hrpX,gus组织染色实验进一步证实了xb002对hrpX的调控作用;通过嵌套互补的方法初步确定了xb002启动子的位置,在引物SCXB02-2R(B)与SCXB02-3R(B)对应核苷酸之间,利用5RACE的方法找到xb002和XC1511的转录起始位点分别位于XC1511 ATG之后431 bp和ATG之前181 bp,与嵌套互补的结果相吻合;然后利用3RACE的方法鉴定出xb002的转录终止位点位于XC1511 TAA之后300 bp,从而确定整个xb002的转录本大小为452 bp,包含了XC1511和XC1510的部分序列,通过Northern blotting进一步验证了xb002转录本的存在;上述一系列的实验结果以及生物信息学分析,推测xb002是以RNA的形式发挥着调控作用而不是以蛋白质形式,同时这也将是黄单胞菌属中鉴定的第一个对hrpG、hrpX发挥作用的RNA。通过培养基生长曲线和叶内生长曲线的测定,结果显示MXB002在培养基中和植物组织中的生长情况与Xcc 8004没有明显差异,推测xb002只与致病力相关而与生长无关;MXB002的HR反应是提前的;致病性实验结果显示,XC1511与Xcc 8004的致病力有关,013B01的HR反应是延迟的,蛋白表达纯化可以将XC1511蛋白纯化出来,EMSA实验表明,XC1511蛋白与hrpX、hrpG的启动子不结合,也就是说,XC1511对hrpX、hrpG的调控作用不是通过与它们的启动子结合而发挥作用。