兽医公共卫生学作为新兴的交叉学科,主要是通过保障动物的健康安全达到保证人类健康的目的,宗旨是研究—切与人类和动物的健康问题有关的知识和资源,以及二者之间的关系来保护和促进人类的美满生活。它具有维护、促进人类健康和保障养殖业发展的双重作用开始受到人们的关注,从而推动了兽医学与医学的相互交叉、相互渗透。然而,人们并没有因此真正认识到动物生命安全在兽医公共卫生中的重要性,人类在兽医公共卫生的实施中忽视动物生命对生态环境平衡起到的作用,过分强调对动物的利用,例如：医学实验、生物实验、基因技术、比较医学、异种移植及人类日常生活等方面对动物的需求量异常庞大,使得可供利用物种的数量变得越来越少。生态平衡的破坏,导致人与动物之间矛盾愈演愈烈。由于人们对动物的传统观念的影响,不能理性认识人与动物之间的关系,造成我国兽医公共卫生研究领域不能得到较好的发展,兽医公共卫生对动物以及人类的作用被曲解。兽医公共卫生不能仅从科学技术上弥补人类在良好环境下生活的想法,以及生态平衡被破坏这一事实。要从观念上抑制人类行为对环境带来的伤害。环境伦理学正好弥补了兽医公共卫生中观念上的缺陷。环境伦理学是一门较新的伦理学说,因为它不是传统伦理学理论在人与动物关系中的应用。而是重新解读人与环境、动物关系的伦理信念、道德态度和行为规范的理论体系,是一门尊重自然和动物自身价值和权利的学科。本文从动物伦理学的视角,审视兽医公共卫生在管理及执行手段上的伦理缺失,以及造成动物疫病流行及新发人兽共患病流行的根本原因。现实社会中无论是集约化养殖还是对动物的基因改造、以生态链原理来治理生态环境等,都是将动物视为“机器”加以利用。兽医公共卫生中主要的伦理困境是：兽医公共卫生利用养殖动物、实验动物以及野生动物来满足人类对美满生活的需求时所产生的人与动物之间的矛盾。人类疾病的产生、环境的恶化都与不尊重动物的权利和自然环境中的规律有关。兽医公共卫生希望通过对动物的控制来改善环境污染、促进人类生活更加美满。但是,随意处置养殖动物、大量实施动物实验、打破自然界中的生物链,这些行为对人类的生活只会带来伤害。对待动物的残忍无视动物权利的观念是导致环境污染、人畜共患病流行的主要原因之一。人类自我为中心的思想得不到扭转,那么,兽医公共卫生想结局的流行疾病问题以及生态环境平衡问题永远无法得到解决。这些手段破坏了动物最基本的生长方式,从而引起各种动物疫病的蔓延。科学技术的飞速发展并没有遏制动物疫病的发生,因此仅仅依靠科学手段是不能完全解决生物种类减少带来的生态平衡破坏问题及畜禽疫病流行增多等问题。