靶向高迁移率族蛋白1基因的RNA干扰序列筛选及其生物学活性的研究

来源 :重庆医科大学 重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:connie1234
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目的:筛选抑制高迁移率族蛋白1(high mobility group box1,HMGB1)基因表达的高效小干扰RNA(Small interfering RNA,siRNA)序列,并观察其在体外对炎症反应的抑制作用,为以后脓毒症治疗的提供新的思路。方法:根据siRNA设计的通用原则设计3条HMGB1siRNA序列(位点为1550-1570;775-795;1719-1739)分别命名为HMGB1siRNA1、HMGB1siRNA2、HMGB1siRNA3,BLAST比对以确保所设计的序列不与其他基因同源,用T7RNA聚合酶体外转录系统合成三条siRNAs,然后转染到RAW264.7细胞。用500ng/ml LPS刺激转染过siRNAs的细胞,然后逆转录多聚酶联反应(reverse transcription Polymerase ChainReaction,RT-PCR)检测HMGB1mRNA的表达情况,同时用酶联免疫吸附试验(Enzyme-linked immunoabsorbent Assay,ELISA)测定细胞上清液中HMGB1的释放是否受到抑制。将筛选出的高效干扰序列稀释成不同的浓度,转染入RAW264.7细胞中,在转染前和转染后分别用500ng/ml LPS诱导,然后检测其是否以浓度依赖性的方式抑制HMGB1mRNA表达和HMGB1蛋白释放,同时检测不同时间点细胞上清液中肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor α,TNF-α)、白介素1β(interleukin-1β,IL-1β)含量。结果:在体外用T7RNA聚合酶转录合成的双链siRNA在3%琼脂糖凝胶电泳进行检测,结果显示RNA片段长度和预计的21bp相符,这提示本实验体外合成siRNA成功。合成的三条HMGB1siRNA均能有效的抑制HMGB1mRNA表达和减少HMGB1蛋白的释放,且其中一条HMGB1siRNA的抑制效果最明显。为了观察HMGB1siRNA抑制效应的持续性,本实验在LPS刺激转染细胞24小时后继续培养至48小时,也检测其对HMGB1mRNA表达和HMGB1蛋白释放的影响,结果发现HMGB1siRNA也具备抑制效应,但效果不如24小时的时间点。我们将筛选出的抑制效果最好的HMGB1siRNA稀释成不同浓度预处理RAW264.7细胞。结果发现HMGB1siRNA以剂量依赖性抑制HMGB1。同时检测其是否抑制炎症反应中的其它炎性因子,ELISA检测结果发现: TNF-α、IL-1β含量显著降低,TNF-α在24小时这个时间点抑制效果最明显,而IL-1β在抑制效果最明显出现在16小时。为了评估siRNA的治疗效应,我们用LPS刺激RAW264.712小时后转染HMGB1siRNA。结果显示:与单独用转染试剂处理的细胞相比,不同浓度HMGB1siRNA。均能抑制HMGB1mRNA表达,也抑制HMGB1释放。结论:T7RNA聚合酶体外转录法合成的siRNA量大是一种简单而快速的方法,该方法合成的siRNA能在体外有效降低HMGB1和其它炎性细胞因子的表达,从而缓解炎症的进一步发展,本实验筛选出的siRNA序列有望成为一种治疗炎性疾病的高效药物,具有一定的开发潜力。
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