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水环境是人类社会赖以生存的基础,在调节全球气候、维持自然环境的稳定性中发挥着不可替代的作用。人类的干扰和破坏使水环境污染发展为当今世界最主要的环境问题之一,污染水体对人体健康,工业、农业、渔业消费等都会产生巨大影响。微生物由于其数量多、分布广、多样性丰富以及对理化性质极为敏感等特点,可以用来指示环境的污染状况。筛选不同污染程度的指示微生物,有助于全面了解水体的质量情况,为预测水体污染趋势,快速评估水体污染现状提供理论指导与科学依据。本研究选取8个我国北方纳污坑塘为研究对象,根据水质综合污染指数将坑塘分为轻度、中度和重度3个污染梯度,采用16S rRNA基因高通量测序技术研究水体和沉积物中的微生物群落特征及其在环境中的指示作用,结果表明:（1）不同污染程度坑塘水体中的TN、TP、NH3-N、COD值严重超出《地表水环境质量标准》（GB3838-2002）中的V类标准限值,随着污染程度增加,除p H以外的各项理化性质指标值均逐渐上升;坑塘沉积物中重金属含量全部低于《农业底泥污染物控制标准》（GB4284-2018）中的A级标准限值。（2）水体污染程度显著影响了水体中细菌群落的α多样性、结构与组成;随着污染程度增加坑塘水体微生物群落构建过程中随机过程所占比例逐渐减小并趋向于以环境选择为主的确定性过程;通过LEfSe分析筛选出水体样品中放线菌目（Actinomycetales）、浮霉菌科（Planctomycetaceae）为轻度污染指示微生物,厌氧绳菌目（Anaerolineales）、酸微菌目（Acidimicrobiales）、酸微菌科（Acidimicrobiaceae）为重度污染指示微生物。（3）沉积物样品中污染程度显著影响了细菌群落的α多样性、结构与组成;随着污染程度增加坑塘沉积物微生物群落构建过程中随机过程所占比例逐渐降低;通过LEfSe分析筛选出沉积物样品中梭菌目（Clostridiales）为轻度污染指示微生物,丹毒丝菌目（Erysipelotrichales）、乳杆菌目（Lactobacillales）、Synergistales目、拟杆菌目（Bacteroidales）、Flavobacteriales目、Erysipelotrichaceae科、Synergistaceae科、紫单胞菌科（Porphyromonadaceae）、Cryomorphaceae科为重度污染指示微生物。该论文有图20幅,表20个,参考文献115篇。