利玛原甲藻(Prorocentrum lima)是一种常见的海洋底栖甲藻,也营浮游生活,是腹泻性贝毒(Diarrhetic Shellfish Poisoning, DSP)的主要来源之一,可通过食物链导致人类食物中毒,已引起人们的广泛关注。要减少利玛原甲藻的危害,就必须在利玛原甲藻造成危害之前便充分掌握当地海域自然水体中是否存在利玛原甲藻及其在水体中的数量,研究利玛原甲藻快速检测技术的重要性不言而喻。本研究选择利玛原甲藻18S rDNA区域中与其它浮游植物有显著差异的区域,设计出适合于利玛原甲藻荧光定量PCR的引物并验证了引物的特异性,建立了应用SYBR Green实时荧光定量PCR技术快速定性定量检测利玛原甲藻的方法,绘制了定量计数标准曲线,并用已知细胞数量的样品验证了该检测方法的准确性。结果表明,在理论上,当待测样品中含有4个利玛原甲藻细胞时便可用该方法检测出,灵敏度较高；在实际生态调查研究中,用该检测方法测得的细胞数为505(±14.72)cells/L(镜检值为600cells/L),误差值为15.83%,符合海洋调查规范中浮游生物调查误差在20%以内的要求,完全可以满足在生态学研究中对于有毒藻类预测预报的需要。本方法拥有较高的特异性,准确性和灵敏度,且操作过程简单、省时,3小时内即可完成,对于大样本的检测具有现实意义,可作为海洋环境监测中定性定量检测利玛原甲藻的方法。