磷烯作为一种新兴的二维纳米材料,拥有独特的褶皱蜂窝状结构和优秀的电子学性质,被科学界认为是继石墨烯之后,一个功能更强大的纳米材料,将有希望被应用于各个领域。因此,极高的应用价值对磷烯材料本身的生物安全性提出了很高的要求,需要我们对磷烯在器官和组织层面、细胞层面和分子层面的生物兼容性作出全面性的评价。本文采用分子动力学模拟的方法,从分子尺度研究磷烯与生物蛋白WW domain以及HP35之间的相互作用。1、磷烯具有一定的纳米毒性,根据WW domain与磷烯接触方式的不同,能产生两种不同形式的破坏。Ⅰ、竞争吸附：磷烯能够促使原本与WW domain结合的配体PRM脱附,造成结合状态的破坏,但是不影响WW domain本身结构；Ⅱ、结构破坏：磷烯能通过吸附WW domain中的第三条p单链,对p结构造成破坏。此外,在没有PRM的体系中也同样发现了这种破坏。这种混合的破坏模式,说明磷烯作为一种高性能的纳米材料,在蛋白质与材料的相互作用过程中扮演着一个灵活多变的角色,既体现了零维材料的竞争吸附性质,又体现了一维材料的破坏性质。2、磷烯除了能够破坏β结构的蛋白质以外,同样能够破坏含有α螺旋结构的蛋白质HP35。通过比较磷烯和石墨烯对HP35结构的破坏程度,发现磷烯由于不能与芳香族残基形成π-π相互作用,其纳米毒性要弱于石墨烯。这表明,磷烯很有希望作为石墨烯的一种低毒代替材料,应用于其它领域。