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小麦是一个重要的粮食作物，在全球122多个国家和地区种植。小麦是重要的淀粉、可消化蛋白质、碳水化合物和纤维来源之一，被至少上千万个人食用。在中国小麦产区主要在半干旱地区，鉴定耐盐种质资源，对小麦耐盐性遗传育种研究具有重要意义。本研究以281份中国主要冬麦区和国外冬小麦品种进行了耐盐性综合评价和耐盐指标的筛选，并分别以小麦90KSNP芯片和50KSNP芯片分别为对205份冬小麦品种(系)构成的自然群体和来自CIMMYT的Berkut和Worrakatta为亲本进行杂交构建的F6群体(共233家系)进行了全基因组关联分析和全基因组连锁分析。主要结果如下：
1.以350mmol/L浓度的NaCl模拟盐胁迫环境，对281份冬小麦品种(系)进行种子萌发期耐盐性进行综合评价及耐盐性指标的筛选。NaCl胁迫条件下各指标测量值较对照均下降，且各耐盐指标之间存在极显著或显著正相关。利用相对盐害率法进行耐盐性分析，发现不同小麦品种(系)间表现出较大差异，相对盐害率的变幅为0.00~97.4%；通过聚类分析，将材料按耐盐性的强弱可分为高耐型(9个/占供试材料的3.20%)、耐盐型(18个/6.41%)、中耐型(30个/10.68%)、敏感性(151个/53.74%)和高敏感型(73个/25.98%)等5类。因子分析表明，发芽率、苗高和胚芽鞘长在萌发因子和伸长因子中的载荷量分别为0.64，0.87和0.92。以上结果说明，发芽率、苗高和胚芽鞘长可作为小麦萌发期耐盐性鉴定的可靠指标，新冬24号、石冬8号、内乡5号、伊农20、新冬7号、工农19、泰山5号、洛夫林10号和Barra等9份高耐性品种为进一步抗逆育种利用和耐盐性基因挖掘提供了基础材料。
2.结合萌发期耐盐性表型数据和小麦基因组的15,831个均匀分布的SNP标记进行全基因组关联分析。使用最优化的混合线性模型(Q+K)进行QQ图，在P≤1×10-4水平下，在两种条件平均值，耐盐系数条件和综合耐盐能力系数(D值)下分别检测到检测到139、108和20个相关耐盐性的SNP位点，解释率范围分别为5.4%~20.5%、5.6%~21.7%和5.5%~14.9%的表型变异；通过筛选显著关联位点上、下游各1MB区域内的基因，共找到28个候选基因，这些候选基因大部分主要是核酸内切酶(Endonuclease)、F-box家族蛋白(F-box family protein)、跨膜蛋白(Transmembrane protein)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Serine/threonine- protein kinase)、受体样蛋白激酶(Receptor-like protein kinase)和转录因子(Transcription factor)有关。
3.利用50K的SNP芯片对来自CIMMYT的Berkut和Worrakatta为亲本进行杂交构建的F6群体(共233家系)进行全基因组连锁分析，共检测出20个主效QTL位点，它们分别位于染色体3A、4A、4D、6A、6D和7A等6条上，LOD值介于2.51~4.75，表型变异率介于4.96%~8.84%之间，其中QRN.xjau-4D表型变异率最大(8.84%)。耐盐性相关的QTL在染色体上成簇分布，主要分布于第3A和4D染色体上，这可能与耐盐相关性状间显著或极显著相关有关。其中，在3A和4D染色体上发现了QTL簇。位于3A染色体上，距离662.94~700.22Mb、697.55~721.35Mb、21.22~47.08Mb和697.55~724.31Mb的SNP位点和QTL为同一位点，可以进一步研究。此外，QTL簇里选出10个候选基因，这些候选基因分别为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Serine/threonine-protein kinase)、蛋白激酶(Protein kinase)、F-box家族蛋白(F-box family protein)和谷胱甘肽家族蛋白(Glutaredoxin family protein)有关。
1.以350mmol/L浓度的NaCl模拟盐胁迫环境，对281份冬小麦品种(系)进行种子萌发期耐盐性进行综合评价及耐盐性指标的筛选。NaCl胁迫条件下各指标测量值较对照均下降，且各耐盐指标之间存在极显著或显著正相关。利用相对盐害率法进行耐盐性分析，发现不同小麦品种(系)间表现出较大差异，相对盐害率的变幅为0.00~97.4%；通过聚类分析，将材料按耐盐性的强弱可分为高耐型(9个/占供试材料的3.20%)、耐盐型(18个/6.41%)、中耐型(30个/10.68%)、敏感性(151个/53.74%)和高敏感型(73个/25.98%)等5类。因子分析表明，发芽率、苗高和胚芽鞘长在萌发因子和伸长因子中的载荷量分别为0.64，0.87和0.92。以上结果说明，发芽率、苗高和胚芽鞘长可作为小麦萌发期耐盐性鉴定的可靠指标，新冬24号、石冬8号、内乡5号、伊农20、新冬7号、工农19、泰山5号、洛夫林10号和Barra等9份高耐性品种为进一步抗逆育种利用和耐盐性基因挖掘提供了基础材料。
2.结合萌发期耐盐性表型数据和小麦基因组的15,831个均匀分布的SNP标记进行全基因组关联分析。使用最优化的混合线性模型(Q+K)进行QQ图，在P≤1×10-4水平下，在两种条件平均值，耐盐系数条件和综合耐盐能力系数(D值)下分别检测到检测到139、108和20个相关耐盐性的SNP位点，解释率范围分别为5.4%~20.5%、5.6%~21.7%和5.5%~14.9%的表型变异；通过筛选显著关联位点上、下游各1MB区域内的基因，共找到28个候选基因，这些候选基因大部分主要是核酸内切酶(Endonuclease)、F-box家族蛋白(F-box family protein)、跨膜蛋白(Transmembrane protein)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Serine/threonine- protein kinase)、受体样蛋白激酶(Receptor-like protein kinase)和转录因子(Transcription factor)有关。
3.利用50K的SNP芯片对来自CIMMYT的Berkut和Worrakatta为亲本进行杂交构建的F6群体(共233家系)进行全基因组连锁分析，共检测出20个主效QTL位点，它们分别位于染色体3A、4A、4D、6A、6D和7A等6条上，LOD值介于2.51~4.75，表型变异率介于4.96%~8.84%之间，其中QRN.xjau-4D表型变异率最大(8.84%)。耐盐性相关的QTL在染色体上成簇分布，主要分布于第3A和4D染色体上，这可能与耐盐相关性状间显著或极显著相关有关。其中，在3A和4D染色体上发现了QTL簇。位于3A染色体上，距离662.94~700.22Mb、697.55~721.35Mb、21.22~47.08Mb和697.55~724.31Mb的SNP位点和QTL为同一位点，可以进一步研究。此外，QTL簇里选出10个候选基因，这些候选基因分别为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Serine/threonine-protein kinase)、蛋白激酶(Protein kinase)、F-box家族蛋白(F-box family protein)和谷胱甘肽家族蛋白(Glutaredoxin family protein)有关。