中华绒螯蟹是我国重要的经济水产物种。短尾类甲壳动物在幼体期完成了一个短尾化的变态发育过程,在长期的系统进化过程中经历了独特的短尾化改变,例如腹肢退化、整个腹部形状变扁并反转贴于头胸部下、头胸部变宽、失去游泳功能等。但是目前对短尾化机制的研究尚未报道,构建中华绒螯蟹的转录组和表达数据有利于探索短尾化的分子机制。我们课题组采用新一代测序技术构建中华绒螯蟹幼体转录组(RNA-Seq)和中华绒螯蟹9个不同发育时期(卵、蚤状卵、蚤状幼体Ⅰ期、蚤状幼体Ⅱ期、蚤状幼体Ⅲ期、蚤状幼体Ⅳ期、蚤状幼体V期、大眼幼体期、仔蟹Ⅰ期、仔蟹Ⅱ期、仔蟹Ⅲ期)的数字基因表达谱(Digital gene expression,DGE),并进行数据分析以期初步探究在中华绒螯蟹幼体发育过程中起重要作用的基因。通过对转录组数据分析,得到76112条Unigene,BLASTX和ESTscan软件分析,有28129条编码序列(CDS)。9个DGE文库两两比对分析了基因的差异表达情况,并得到了各发育时期的共有表达基因和特异表达基因。并获得两个热休克同源蛋白EsHSC70-3和EsHSC70-5(登录号:KC493625和KC493626)的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学进行初步分析。