中央新疆工作座谈会的召开以及中央出台一系列支持新疆跨越式发展的政策和措施，给新疆大建设、大开发、大发展带来了前所未有的历史机遇。“十二五”开局之年新疆经济社会又呈现出良好的发展势头，经济的高速发展辅佐以适合的产业结构是未来新疆经济增长的主要推动力。在影响经济增长的众多因素中，外商直接投资作为经济发展中的一个不可忽视的因素，其投资结构会直接影响到产业结构，而产业结构的合理化发展又能促进经济健康平稳发展。新疆的外商直接投资规模虽较以前有了很大改观，但数额仍然较小，对产业结构的影响作用还十分微弱，随着新疆的战略地位越来越重要，理论上讲，外商直接投资对新疆产业结构调整的影响研究是具有前瞻性的。文章通过分析新疆外商直接投资的产业结构现状发现，有限的外资分布存在着极大的不平衡性：(1)产业分布不均衡。外商直接投资主要集中在第二产业和第三产业，第一产业的外资规模很小。(2)地域分布不均衡。外资主要集中在经济发展快，基础设施和投资软环境较好的地区。(3)外商直接投资规模和技术的非均衡性。新疆外资主要集中在劳动密集型项目，中小型项目和一般加工项目。通过对新疆外商直接投资的产业间效应的测算得出如下结论：新疆实际外商直接投资对三次产业产值影响大小依次为第二产业、第三产业、第一产业，这与现阶段新疆的产业结构的调整方向呈正向相关关系，是符合实际的。但由于外资的进入同时会对产业结构造成一定的偏差，而这种偏差是由外资进入三大产业的典型行业与我区引资结构不匹配造成的，通过测算得出：对三次产业造成的偏差依次为-5.94%、5.16%、0.78%。从外商直接投资调整新疆产业结构的角度来看，由于外资的产业投资结构与新疆现阶段产业结构的调整方向是吻合的，因此，应以完善的政策、法律体系，加之完备的基础设施来改善投资环境，让外商直接投资的数量上有所突破。从外商直接投资在产业内部的分布来看，由于外资对产业内部的典型行业的投入存在的非均衡性与现阶段的调整重点有偏差，要以技术创新优化外商直接投资的产业结构，开展合理的招商引资工作；以多样化的内外资合作形式，在引资的同时避免外资进入带来的产业结构冲击，使得外资不仅能够补充资金在某些领域的空白还能带动本地产业的发展。