在2020年的年初之时,我国突然爆发了一轮传染性极其强烈的新冠肺炎疫情。面对该种爆发感染性极强的传染性疾病,我国的31个省份在此时刻均启动了当地重大突发公共事件卫生1级预案,自中央政府到地方出台了多项针对性的地方防疫政策,同时在全国各地也投入了大量的人力物力和财力,来进行疫情防控。一方面要确保中央的财政资金拨付款项到位,同时要确保高效的资金运作效率,另一方面确保资金的正常运作使用也是重要的一个环节,而这些要依靠着国家审计的监督力量才能有效执行。然后就目前来看,在应对疫情的的防控过程中,需对防疫物资分配流程的合规性,合法性以及合理性进行及时监督,然而,我国尚无一套完整的评价标准体系对此进行裁决。因此,找到一套适合的审计方法,并构建一套完善的体系,对于当前的常态化防控疫情的背景下逐步开展一系列审计工作是十分有必要的。由于重大突发性公共事件出现概率十分稀少,然一旦发生所造成之影响十分重大,并持续时间可能非常长久,例如往年的汶川地震,以及现在依旧尚未结束的新冠肺炎疫情。同时在明确疫情防控经费物资审计,具体突发公共事件应急审计和政策落实审计双重属性的基础上,查阅了国内外在应对类似的疫情防控政策后,总结了部分成功处理此类事件的经验,并结合审计署相关反馈和防控措施的要求后,选定了跟踪审计的方式,对审计评价中相关疫情防控经费物资统筹接受,使用管理等方面进行开展。也通过对相关理论例如公共受托责任理论、免疫系统论、国家治理理论等进行解释,为新冠肺炎防控的跟踪审计提供理论基础支持。同时分析了重大突发公共事件下跟踪审计的必要性,审计主体和对象等,也确立了相关审计指标构建框架的基本原则,构建出一套完善的评价指标体系。同时案例采用了H省政府进行研究,通过对H省整体的防控疫情物资的调配差遣、拨付接受、和筹集管理的整体流程,通过对其进行分析探究,进而在发现了该省在防控疫情物资的调配差遣、拨付接受、和筹集管理的总体过程中具有优秀的表现,不过其中部分地方尚存在待完善之处。全文最后就经费物资有关的部分落实方针,以及疫情防控管制的有关政策提出意见和建议,希望能给目前所发生的重大突发性公共事件,和日常状态下的疫情防控提出部分参考性意见,同时可以对跟踪审计的的方法和理论建设起到丰富作用。