在公司治理领域的研究中,终极股权结构问题日益成为研究者关注的焦点。终极控制权是我国证券市场许多不规范行为的重要症结所在。上市公司的终极控制人通过建立金字塔式持股或者交叉持股等方式取得对目标公司的控制权,由此实现以较少的股份掌握较大的控制权的效果。这种控制方式的显著特点是产生了终极控制权与现金流量权的分离,有利于大股东掩饰自己的利益攫取行为,由此可能导致终极控制人对中小投资者利益的侵害。由于我国目前对中小股东的法律保护还很不完善,这也使得我们从理论和实践上研究上市公司终极股权结构具有很重要的现实意义,以期对如何优化终极股权结构来提高经营业绩、促进企业发展和保护中小股东提出合理的建议。本文在回顾了国内外研究成果的基础上,结合股权相关概念和理论,通过股权结构链层层追溯上市公司的终极控制人,首先分析了终极股权结构与公司绩效的关系,并提出假设,然后运用SPSS17.0和Exce12003统计软件,以我国沪市A股271家制造业上市公司做为样本,选取2008-2010三年的数据,建立回归模型,通过模型的描述性统计与回归检验得出了如下结论：实际控制人的性质为国有的公司的绩效并不显著低于民营控制的公司的绩效；我国上市公司存在严重两权分离的情况,民营性质的实际控制人平均拥有的控制权、现金流量权比例都明显低于国有性质实际控制人的；终极控制股东的控制权比例与公司绩效呈现出非线性关系,公司绩效随终极控制股东控制权比例的提高先下降后上升然后再下降,两个拐点为23.67%和64.95%；我国上市公司终极控制人的现金流量权与公司绩效正相关；我国上市公司实际控制人的两权分离程度与公司绩效负相关；国营控制上市公司的金字塔控股层级的合理安排具有一定的激励效应,但溢价效应并不是很明显,且控制层级为4时绩效最好,而民营控制下控制层级与公司绩效是负相关的,未通过显著性水平为0.05的显著性检验,但是如果把显著性水平放宽到0.1时,则恰好通过显著性检验；股权制衡度、公司规模和成长性对公司绩效产生显著的正相关影响,而资本结构对公司绩效产生显著的负相关影响,说明杠杆效应没有对公司绩效的提高起到促进的作用。最后,在实证研究的基础上,本文针对研究结果提出相关政策建议,同时对全文研究结果进行了总结归纳,提出研究展望。