中国汉族人群儿童孤独症的UBE3A基因突变筛查

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目的15q11-13区域是人类基因组中最复杂的染色体区域之一,研究发现15q11-13区缺失和重复个体中存在孤独症样的临床表型,而15q11-13区重复也是孤独症人群中最常见的拷贝数变异。UBE3A基因位于15q11-13区,编码泛素-蛋白连接酶E3A,是孤独症重要的候选基因。本研究在中国汉族孤独症人群中筛查UBE3A基因变异并分析变异与孤独症的相关性。方法1.通过高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)和Sanger测序法对192例儿童孤独症患者(病例组)和192例健康对照(对照组)进行UBE3A基因编码区及其邻近非编码区域的突变筛查。2.对突变筛查发现的变异通过HRM的方法扩大样本验证,分析变异的分布频率在孤独症患者和健康对照组间的差异。结果1.在UBE3A基因的第4个编码区域(CDS4)发现一个已知的单核苷酸置换(T>C,rs150331504),为同义突变。在筛查样本中,病例组有4例、对照组有1例携带该变异;扩大样本后,该变异在病例组和对照组中的发生频率分别为10/384、5/384,两组间差异无统计学意义。分析比较携带rs150331504不同等位基因所编码m RNA的最小自由能,结果显示rs150331504的等位基因T和等位基因C的最小自由能存在一定差异,说明该变异可能改变了转录过程中的m RNA二级结构。其余编码区域未见变异。2.在UBE3A基因第2个编码区域(CDS2)上游288bp处发现了5个碱基的插入缺失(AACTC+/-,rs71127053),在筛查样本中病例组和对照组的频率均是16/192(>5%)。扩大样本后进行关联分析,rs71127053的等位基因和基因型分布频率在病例组和对照组间无显著性差异(P>0.05);在不同遗传模式下,rs71127053的基因型分布频率在病例组和对照组间无显著性差异(P>0.05)。结论在中国汉族人群中,UBE3A基因可能与孤独症不相关。
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