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背景和目的：CpG岛甲基化表型(CpG island methylator phenotype, CIMP)是存在于多种肿瘤中的一种表观遗传学现象,参与肿瘤的发生发展。异常DNA甲基化的明确可用于肿瘤的早期诊断、治疗以及风险评估。本研究的目的是明确骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndrome, MDS)的CIMP,为MDS的早期诊断和预后预测提供新的生物标记物。方法：我们使用Illumina450k甲基化芯片和Agilent全基因组表达谱芯片进行差异基因筛选,筛选出高甲基化低表达基因初步建立MDS的CIMP。通过甲基化特异性PCR (methylation-specific PCR, MSP)验证基因的甲基化、重硫酸盐测序(bisulfite-sequencing PCR cloning and sequencing, BSP)验证MSP的准确性和实时荧光定量PCR (real-time PCR, qRT-PCR)验证基因表达的方法在样本病例组及对照组中对筛选出的基因进行进一步验证。然后通过诊断试验评价的方法评价高甲基化基因单独或联合诊断MDS的效能。并通过Kaplan-Meier曲线计算CIMP亚组的无白血病生存时间和总体生存时间,采用Log-rank检验进行单因素的生存分析,且将单因素分析中有意义的因素纳入COX回归模型进行多因素分析,以明确CIMP是否是影响无白血病生存时间和总体生存时间的独立预后因素。结果：我们通过甲基化芯片和表达谱芯片联合进行差异基因的筛选,筛选出10个高甲基化低表达的基因,初步建立MDS的CIMP。然后在小样本MDS病例组(20例)和血液系统非恶性肿瘤对照组(20例)中进行甲基化和基因表达验证,进一步筛选高甲基化低表达的基因。通过验证,初步建立的MDS的CIMP修订为6个基因。在大样本病例组(211例)中验证结果表明,6个基因发生甲基化的病例数百分比为ABAT(97%)、DAPP1(9%%)、FADD (89%)、LRRFIP1 (96%)、 PLBD1 (89%)和SMPD3 (85%)。诊断试验评价中曲线下面积(95%可信区间)为0.9768(0.9609-0.9928)。5个或5个以上基因同时甲基化时诊断MDS的特异度和灵敏度分别为95%和91%,所以我们将有5个或5个以上基因同时甲基化的病人归为CIMP+亚组。为明确CIMP对MDS患者总体生存时间和无白血病生存时间是否有影响,我们进行了Kaplan-Meier生存分析。CIMP+亚组和CIMP-亚组相比,总体生存时间(p=0.0422)和无白血病生存时间(p=0.0308)均有较明显的统计学意义,证明CIMP+是MDS患者预后差的独立预后因素。单因素分析表明P+/-、年龄、血红蛋白量、MCV、WHO分型、骨髓原始细胞比例、IPSS染色体分组、IPSS外周血细胞减少和IPSS危险分级均是MDS患者总体生存时间和无白血病生存时间的重要影响因素。为进一步评估在单因素分析中有意义的预后因素,我们将这几个因素纳入COX回归模型进行多因素分析,结果显示CIMP+是影响MDS患者总体生存时间(HR=4.82)和无白血病生存时间(HR=3.91)最强的独立危险因素。所以我们确定CIMP是MDS患者的独立预后因素。结论：我们的研究结果表明ABAT、DAPP1、FADD、LRRFIP1、PLBD1、SMPD3这6个基因可以建立MDS的CIMP。新建立的CIMP可能成为MDS的新的生物标记物,用于提高MDS诊断的准确性,也可用于MDS的预后危险评估。