建立现代企业制度是我国经济体制改革的重要内容，有效的公司治理结构是现代企业制度的核心，进行股份制改造，优化股权结构是完善公司治理结构的基础，是影响公司治理绩效的重要决定因素。而我国国有独资公司不合理的股权结构：结构单一、国有股“一股独大”、非流通股比重较大；缺乏有效运作的董事会；亟待形成先进的公司治理文化等。这不利于公司治理结构的形成和治理效率的发挥。随着我国经济体制改革的不断深入发展和现代企业制度的建立完善，要求对国有独资公司的股份制改造和治理结构进行分析研究。本文正是出于这样的考虑，以神华集团的股份制改造和完善公司治理结构为研究对象，对国有独资公司股份制和治理结构的相关理论、模式、现状以及在我国存在的问题及其优化设计进行了系统的分析研究。　　论文首先对股份制和公司治理结构的相关理论进行了回顾与分析，对国际上典型的模式：英美模式和德日模式进行比较研究。在比较分析西方股份制模式和治理结构的基础上，结合实际资料，对大型能源企业－神华集团公司的股份制改造和治理结构现状进行了分析，并对公司股份制改造和完善治理结构的过程中存在的问题进行了研究和评价。然后对二者的互动关系进行理论研究和实证分析。在此研究的基础上，最后提出了优化公司股权结构、建立高效运作董事会、共同治理、提高治理效率等完善公司治理的思路。论文选取了神华公司股改的实际资料，运用理论与实践相结合的方法，借鉴西方模式中的合理因素，对其进行系统分析和实证检验，并针对存在的问题，提出了改进建议和对策，这对于不断变革之中的国有独资中央企业进行股份制改造和完善治理结构具有重要的借鉴意义和现实的指导意义。