广西三地旋毛虫基因差异研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:lcc2451
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目的:分析广西三地(龙州、南丹、德保)旋毛虫分离株与河南旋毛虫分离株之间的基因差异以及与Genbank中旋毛虫种的基因差异,判断各分离株之间的亲缘关系;阐述旋毛虫自然感染龙州果子狸宿主的部分生物学特征,为探讨广西旋毛虫病爆发的原因提供科学依据。方法:对广西旋毛虫3个分离株和河南旋毛虫分离株基因组DNA进行提取,选取核糖体DNA(rDNA)的5S rDNA基因、线粒体DNA(mtDNA)的细胞色素氧化酶1(COX1)基因和线粒体DNA大亚基(mt-lsrDNA)基因作为分子标记,对目的基因进行PCR扩增,并采用双向测序法或T-A克隆测序法对PCR产物进行测序。应用Clustal X软件对旋毛虫基因序列进行排列比较,应用Dnastar软件包比较序列的同源性。然后采用Kimura双参数法计算遗传距离,采用邻接法(N-J法)、非加权组平均法(UPGMA)和最大简约法(MP)分别构建系统发生树,并且与Genbank已知的旋毛虫相应基因序列进行对照比较。同时对龙州果子狸旋毛虫分离株进行囊包形态学、毒力和保姆细胞形成时间进行实验观察。结果:龙州旋毛虫分离株、南丹旋毛虫分离株及德保旋毛虫分离株与基因库中T.spiralis 5S rDNA的相似度为98.3%~99.1%,遗传距离为0.014~0.028。龙州旋毛虫分离株、南丹旋毛虫分离株及河南分离株与基因库中T.spiralis COX1基因的相似度为98.8%~99.0%,遗传距离为0.003~0.005。龙州旋毛虫分离株、河南分离株与基因库中T.spiralis的mt-lsrDNA相似度分别为99.8%和99.5%,二者与基因库中T.spiralis的遗传距离则分别为0.003和0.005。四株分离株之间的相似度及遗传距离进行比较,龙州旋毛虫分离株、南丹旋毛虫分离株、德保旋毛虫分离株5S rDNA的相似度为97.6%~98.8%,遗传距离为0.014~0.028。龙州旋毛虫分离株和南丹旋毛虫分离株、河南分
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