自中国人民银行有关电子票据系列部门规章颁布,电子票据法律效力问题得到有效解决,然而,电子票据签章安全性随之暴露,成为制约电子票据发展的主要因素。在探求如何保障电子票据签章安全性问题上,首先应当厘清影响电子票据签章安全性的因素:可靠的电子签名和电子签名认证。我国《电子签名法》移植联合国贸易委员会1993年颁布的《电子商务示范法》,采用折衷立法模式,因而造成可靠的电子签名判定标准过于原则化。电子票据系统参与者之间,与系统参与者与客户之间采用不同的第三方电子签名认证,以及不同的法系对于电子签名和电子签名认证方法的应用和效力规定不一致,造成了电子票据交易中电子签名认证系统不兼容,包括国内电子认证系统参与者与客户之间电子认证系统不兼容,国内电子认证系统与国外电子认证系统不兼容两个方面。此外,认证机构自我鉴定模式和银行自建认证机构,有即是裁判员又是运动员的嫌疑,造成电子认证机构中立性不足,是我国电子票据签章安全性现存的主要问题。针对上述问题,提出以下完善电子票据签章安全性的思路:一是细化可靠的电子签名判定标准,导入技术特定模式通过修改《电子商业汇票业务管理办法》细化电子票据签章中可靠的电子签名判断标准,具体标准应当考虑法律、技术、商业三个方面的因素。二是建立交叉认证机制,采用严格层级模式建立公钥基础设施,从而推进境内各认证系统之间的交叉认证和证书互认,此外借鉴我国票交所的成功经验,建立世界范围内或者区域内的统一电子交易平台,来解决境内外电子认证互联互通问题。三是引进电子公证和司法鉴定机制,将电子公证通过互联网与电子票据交易平台对接,实现对电子票据交易的事前、事中监督,司法鉴定作为弥补电子票据交易的事后监督,最终实现对电子票据交易全流程的监管。