GWAS研究SNP位点与中国人群HIV-1感染者疾病进程和疗效相关性研究

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[目的]全球已进行了多个艾滋病全基因组关联分析(GWAS),发现了许多与艾滋病疾病进程相关的新位点,目前尚无在亚洲人群开展的对已发现GWAS位点的研究报道。本研究将探讨GWAS研究位点在中国人群与疾病进程的关系,并探讨部分与疾病进程有关的经典位点在中国人群与疾病进程和HAART疗效的相关关系[方法]研究对象共纳入HIV感染者1098例,来自四个随访队列;以CD4细胞下降率为疾病进程观察指标,以至病毒有效抑制时间(VL<400/mL)和至病毒完全抑制时间(VL<50/mL)为疗效观察指标;共选择GWAS研究结果及部分经典位点共18个;从全血中提取DNA,以MassARRAY分型平台进行基因分型;使用秩和检验和卡方检验分析不同基因型的效应。对发现的与疾病进程相关的阳性位点,在长期不进展人群中进行验证。[结果]对基因分型结果进行检出率和哈迪-温伯格平衡检验,最终共14个位点纳入研究。疾病进程研究样本共376例,结果发现GWAS研究位点rs9264942、 rs13199524和rs12198173与中国人群HIV感染者CD4细胞计数下降的速率有显著相关关系,在中国HIV感染者典型进展人群与长期不进展人群中分布有显著性差异。rs2395029位点在中国HIV感染者典型进展人群与长期不进展人群中分布有显著性差异。与疾病进程有关的经典位点未发现与CD4细胞下降率有相关关系;疗效研究样本共531例,发现治疗基线时病毒载量是治疗至病毒有效/完全抑制时间的独立影响因素。在校正了基线时病毒载量影响后,未发现与疗效有关的经典位点在中国人群与治疗至病毒有效/完全抑制时间有统计学相关关系。[结论]研究首次在中国人群验证了GWAS结果的主要位点,证明在控制HIV病毒复制和疾病进程上,6号染色体MHC区对于中国人群均起中心作用。治疗基线时病毒载量是治疗至病毒有效/完全抑制时间的独立影响因素,提示对于基线病毒载量较高的患者,应使用更强效的HAART治疗方案,以预防耐药的发生。
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