进入21世纪以来,卫生服务管理变得更加具有挑战性。在我国的卫生事务领域,政府卫生管制的实践将逐步的转向卫生治理的模式上来,最终实现从统治到治理、从善政到善治的变革。非营利医院作为提供公共医疗服务的主体,成为这场变革的重中之重。现代非营利组织的治理理念认为,公共治理的主体是多元的,一个良好的治理结构需要不同治理主体形成良好的伙伴关系。因此,基于组织理论和新公共管理理念,本文认为非营利医疗机构的治理框架涉及一系列的制度安排,包括以治理结构为核心的的内部治理机制和以多方监管为核心的外部治理机制,并试图提出我国非营利医疗机构改革的应然框架。全文共分为四个部分:第一部分,非营利医疗机构治理的基本理论,包括非营利组织的起源、治理在新公共管理语境下的新内涵,以及治理理论在不同组织中的发展脉络。从公司治理结构到非营利医疗机构治理,治理理论在组织层面的发展呈现出一些新的趋势。第二部分,我国非营利医疗机构产生的政策背景,即医疗机构分类管理制度。通过把这一政策置于医疗卫生体制变迁之中,介绍分类管理政策的主要内容,分析重大意义,并做政策评估,结论是没有达到完全的预期效果。第三部分,我国非营利医疗机构存在的组织治理困境。自分类管理政策执行以来,非营利医疗机构组织治理的问题体现在内部治理杂乱和外部治理虚化两个维度。第四部分,完善我国非营利医疗机构的内外治理框架,涉及非营利医疗机构的一系列制度安排,包括以治理结构为核心的的内部治理机制和以多方监管为核心的外部治理机制,并在借鉴国际经验的基础上,试图提出一些政策建议。