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樟树(Cinnamomum camphora)作为亚热带常绿阔叶林常见的第三纪孓遗树种,进化历史悠久。目前樟树在许多地方都广泛栽培,且在园林绿化、精油提取、木材家具等方面应用广泛。然而,近年来受人类活动和环境变化的持续影响,樟树的自然资源已消失殆尽,野外仅保留极少数的古樟群体等种质资源,这非常不利于樟树资源的开发利用和资源保护。因此,开展樟树群体遗传学研究对于揭示其遗传结构,阐明其演化规律具有重要意义,研究结果不仅为樟树遗传资源保护策略制定科学依据,同时对樟树种质资源的评价与利用、良种选育等提供理论基础。主要研究结果如下:1.SSR引物筛选。本研究从已发表的22对樟树SSR引物中,筛选出11对扩增效果好且多态性较高的引物。同时利用芳樟叶的转录组数据,选取二核苷酸重复的潜在SSR标记位点,共设计了16对高重复率的引物。通过PCR扩增和多态性检验,筛选出条带清晰、重复率好和多态性高的9对SSR引物。因此,本研究共筛选出20对多态性SSR引物用于后续樟树遗传多样性分析,分别是Cc-A46,Cc-B25,Cc-B29,Cc-B91,Cc-C1,Cc-C87,Cc-C90,Cc-D88,Cc-A4,Cc-B89,Cc-B90,Cc-30,Cc-58,Cc-68,Cc-05,Cc-34,Cc-12,Cc-91,Cc-50,Cc-45。2.SSR遗传多样性分析。利用这20对引物对樟树21个群体241个个体进行遗传多样性研究。20个位点共检测到200个等位基因,平均有效等位基因数量(Ne)为7.114,平均观测杂合度(Ho)为0.977,平均期望杂合度(He)为0.785,多态信息含量PIC为0.754。樟树具有较高水平的遗传多样性(He=0.785)。3.樟树群体内和群体间遗传多样性。群体内平均近交系数Fis值为-0.047,群体间平均近交系数Fit为0.067,群体间平均遗传分化水平Fst的值为0.109,古樟群体遗传多样性水平较高,具有中等水平的遗传分化。樟树群体的基因流Nm的最小值为1.120(Cc-B90),最大值为3.972(Cc-12),平均值为2.047,说明较高的基因流阻碍了群体间遗传分化的发生。Mantel检验表明群体遗传变异与地理距离呈显著相关关系。聚类分析结果表明21个樟树群体被分为南部、西南部、中部Ⅰ和中部Ⅱ四大类群,其中中部Ⅰ的遗传多样性最高,但是南部居群的稀有等位基因丰富较高,应注意这些边缘区域的样品采集和深入研究其遗传结构。4.叶绿体基因单倍型分析。本研究选取了8个变异较大叶绿体基因片段对樟树群体进行单倍型分析。然而,所选取的基因片段没有在樟树群体中找到任何变异,被检测群体的序列信息完全相同。这预示着樟树进化历史复杂,在后续研究中应加强基因筛选,或者结合高通量技术在群体内进行遗传结构分析。研究结果不仅可以为樟树资源的保护提供科学依据,为育种提供资源,而且有利于樟树遗传资源的可持续开发和利用。