铁路运输业关系国计民生,因其公益性和巨大的正外部性,我们不能忽略发展铁路运输和完善制度建设。而铁路公益性运输补贴机制的建立是我国现阶段迫切需要解决的问题。本文首先从公共物品理论与外部性理论出发,界定了铁路公益性运输的概念与范围。而后分析了建立铁路公益性补贴机制的必要性：有利于外部收益内部化,以激励铁路公司；通过纠正相对价格扭曲,可以增加铁路运输业的竞争力。然后通过分析中国、英国、法国、美国和挪威的铁路公益性运输补贴模式,得到了交叉补贴+亏损补贴方案、特许经营权+最低补贴竞标方案、固定每单位运价补贴合约、土地补贴方案与绩效补贴合约这五种铁路公益性运输服务补贴方案。再从博弈论的角度出发,分析不同补贴制度安排下,参与人的最优反应,更直观地观察到这些不同选择下的收益情况。在博弈分析的基础上,从效率属性、公平属性和交易成本属性这三个角度出发,对五种公益性运输补贴模式进行综合比较。最后以中国现实国情为基础,分析五种补贴方案在我国的适用性,并提出建议：目前的交叉补贴+亏损补贴方案效率最低,应该尽快改革；短期内,对我国铁路公益性运输应该采取绩效补贴与土地补贴相结合的模式；在中期,最合适的补贴机制是政府与铁路总公司签订固定每单位运价补贴合同；从长期看,应将竞争机制引入铁路运输行业,调整铁路运输市场结构,对公益性运输业务进行最低补贴招标,让多家铁路运输企业参与特许经营权竞标。