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紫薄鳅（Leptobotia taeniops）是中国特有淡水鱼类品种，它体型小，属底栖性鱼类。其肉质鲜嫩，营养丰富，体色斑斓，具有较高的经济价值和观赏价值。文中对源自长江铜陵段的紫薄鳅，取其头肾为材料，采用植物血凝素（phytohaemagg lutinin，PHA）和秋水仙碱体内直接注射法制备紫薄鳅染色体标本，并分析染色体的核型；通过线粒体DNA控制区和简单序列重复区间扩增多态性(Inter-simple sequence repeat, ISSR)标记技术，研究紫薄鳅不同体色的两个子群体的遗传多样性。研究结果如下：1.紫薄鳅二倍体染色体数目为2n=50，核型公式为：6m+10sm+8st+26t，臂数为66。2.采用PCR技术和DNA测序技术对紫薄鳅线粒体控制区的遗传多样性进行分析，获得用于分析的控制区片段约961bp。27个样本中共检测到18个变异位点和14种单倍型，单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.8661和0.0038，单倍型的平均遗传距离为0.0052。子群体Q的单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.8180和0.0037，遗传距离为0.0037；子群体S的单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.9000和0.0042，遗传距离为0.0041，群体间的Gst值为0.0068。结果表明，紫薄鳅的遗传多样性较低，子群体S的遗传多样性比子群体Q的稍高，群体间遗传分化程度低。3．试验中，用筛选出的11个ISSR引物对两个群体共74尾紫薄鳅进行遗传多样性分析，总体水平的基因多样性值和shannon信息指数分别为0.1276和0.2129，多态位点比例为60.56%；子群体Q的基因多样性值和shannon信息指数分别为0.1051和0.1794，多态位点比例为53.52%；群体S的基因多样性值和shannon信息指数分别为0.1298和0.2135，多态位点比例为56.34%。结果表明：紫薄鳅群体遗传多样性较低，子群体S的遗传多样性比子群体Q的略高；两个子群体之间的遗传距离为0.0218，Gst为0.0752，表明S和Q群体间的遗传分化程度较低，亲缘关系较近。研究结果丰富了紫薄鳅细胞遗传学参数，为紫薄鳅的种质检测提供了相应技术参数，这不仅为紫薄鳅的种质资源保护、系统演化、进化地位、生化遗传研究提供理论依据，而且为紫薄鳅的野生驯化与遗传育种工作提供了技术设计思路。