梅毒螺旋体核酸检测及基于微滴式数字PCR技术的梅毒螺旋体核酸绝对定量方法学研究

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ldfzcc
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
第一部分各期梅毒外周血中梅毒螺旋体核酸检出率的研究目的利用巢式PCR技术探究各期梅毒患者外周血中梅毒螺旋体DNA的检出率方法临床收集192例梅毒患者外周血样本,其中包括37例一期梅毒,92例二期梅毒,63例潜伏梅毒,利用TP0105和TP0574基因片段特异的内外引物,行巢式PCR技术对样本进行检测。结果一期梅毒患者外周血中梅毒螺旋体的检出率为45.9%(TP0105)和40.5%(TP0574),两基因的总检出率为48.6%;二期梅毒患者外周血中梅毒螺旋体的检出率为52.2%(TP0105)和52.2%(TP0574),两基因的总检出率为62.0%;潜伏梅毒患者外周血中梅毒螺旋体的检出率为6.3%(TP0105)和4.8%(TP0574),两基因的总检出率为7.9%。两基因的检出率在统计学上没有差异(P<0.05),Kappa值为0.714。结论梅毒螺旋体基因可以在螺旋体感染的各个阶段的梅毒患者外周血中检测到,其中在一期梅毒和二期梅毒中的检出率最高。巢式PCR技术在早期梅毒的诊断中起到了重要的作用,可以在临床上用于暗视野镜检和血清学检测的补充诊断标准。第二部分基于微滴式数字PCR技术的梅毒螺旋体核酸绝对定量方法的建立及应用微滴式数字PCR技术是近年来迅速发展起来的一项基于单分子PCR方法来进行计数的核酸分子绝对定量技术,目前基于该技术的梅毒螺旋体绝对定量方法还未有文献报道。本研究建立了微滴式数字PCR梅毒螺旋体核酸绝对定量检测平台,从特异性、灵敏度、可信度、重复性几个方面对平台进行评估,又将建立好的dd PCR检测平台应用于TP感染兔模型外周血的核酸检测,确定该技术的可行性。本研究设计了针对基因分别为TP0105和TP0574的特异性探针,利用ddPCR技术检测了健康人、非梅毒病人、正常兔、鼠血浆中的目的基因片段,确定了该技术的空白下限值(LOB)为3.2copies(TP0105)和1.4copies(TP0574),为后续对于临床样本的检测确定了cut-off值。用dd PCR技术对各稀释梯度的质粒进行核酸定量检测,确定该检测技术的高灵敏度,最低检测下限(LOD)为单拷贝。将每个梯度质粒经dd PCR检测出的实际拷贝数与计算出的理论拷贝数进行相关分析,发现二者呈高度相关性,说明dd PCR技术的检测结果是可信的。为了评估dd PCR的重复性,我们对各稀释梯度兔睾丸悬液的检测均进行了三次重复,对三次拷贝数结果进行分析研究发现每个稀释梯度的RSD值均在可接受的范围内,表明dd PCR具有很好的可重复性。在dd PCR与q PCR的对比研究中我们发现dd PCR具有比q PCR更低的检测下限,灵敏度更高,且dd PCR具有比q PCR更好的重复性,特别是在目的基因处于低拷贝的情况下。本研究利用dd PCR技术动态监测了兔模型对TP的感染情况,发现感染兔外周血中核酸水平的出现早于血清学水平,证实了dd PCR技术的可行性,为后续对于临床样本的核酸绝对定量研究奠定了基础,对指导用于极早期梅毒、胎传梅毒、神经梅毒等早期诊断具有重要意义。
其他文献
湖南省常德市自2004年5月18日正式推行殡葬改革以来,初步形成了“全党动员、全民参与、民政主管、各个部门配合”的运转机制,在社会上引起强烈反响。两年多来,殡葬改革取得重
党的十九大报告提出实施乡村振兴战略,绿色村庄建设正是实现乡村振兴的重要路径之一。文章借鉴美丽乡村、生态村庄等建设经验,结合苏北地区村庄发展现状,从村庄节地情况、建
目的和意义调查武汉社区获得性腹泻病原菌的构成及其主要病原菌—鼠伤寒沙门菌对喹诺酮类药物的耐药情况,并对其主要耐药机制和耐药基因型进行研究。阐明武汉社区获得性腹泻
目的结核性脑膜炎(Tuberculous meningitis,TBM)是结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)感染后最严重的形式,它导致20-25%的感染者死亡,并致使生存患者遗留严重的神
今年4月,市人大常委会机关来了9位挂职锻炼的年轻干部。这群平均年龄41岁的年轻人来自党政、区县和教育等条线,到人大机关已近半年。视察、调研、座谈会……许多场合都活跃着他
进驻有场地、研发有补贴、创业有导师,作为中关村最具创新潜力的群体,科技型小微企业正在这里享受着一系列的“福利”,并在这片创业热土上展现出旺盛的生命力。融资难?租金贵?
针对小功率感应电动机的效率提升问题,探讨了用铜替代铝作为转子导条的方法,在采用转子铸铜后,降低了转子损耗,从而提高了电机效率,可以在小体积上做出更高效率的电机。同时
水资源是基础性的自然资源和战略性的经济资源。因此,世界上不少国家和国际组织采用法律手段对水资源实施保护和管理。随着经济和社会的不断发展,合理开发利用水资源,特别是依法
【事件】日前,金隅集团布局北京未来城市更新发展,在北京西三旗投资首个存量工业厂房升级改造项目--金隅智造工场,以科学合理的改造利用,焕新老旧物业的时代价值,探索城市更
坊主作为教师工作坊研修的负责人,是影响网络研修成败和质量高低的关键。该文在综合在线教师和传统培训师的能力结构基础上提出了包括需求分析与研修规划能力、资源建设与整