随着我国对外经济贸易的高速发展,对出入境检验检疫机构执法能力与行政效率的要求不断提高。如何提升检验检疫机构,尤其是基层检验检疫机构的公共管理和公共服务的绩效,摆在出入境检验检疫机构面前的重要而紧迫的课题。对此现状,本文通过运用公共部门绩效管理的相关理论,借鉴国内外公共部门绩效考核的成功经验,并从常州检验检疫局这一基层检验检疫机构的实际情况出发,对其绩效考核现状进行调研分析,并对现有的绩效考核体系进行了梳理,从指导思想、总体思路、具体步骤、指标权重设定等方面浅析如何构建科学、合理的绩效考核指标体系。并以常州检验检疫局单位绩效考核为例,有效整合各种检查考核方式,从基础考核指标、年度重点工作考核指标、加分标准、下调和一票否决标准等方面来设定绩效考核体系的指标,设计出一套适合基层检验检疫机构科学、合理的绩效考核指标体系。并指出了该考核指标体系运行过程中出现的问题,提出了相应的完善对策,以期进一步加强基层检验检疫绩效考核,促进检验检疫事业的发展。