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荷花(Nelumbo nucifera Gaertn.)为莲科(Nelumbonaceae)莲属(Nelumbo)的多年生水生草本植物,是中国十大传统名花之一。作为最早的被子植物之一,荷花经历了冰川时期,如今仅存有两个种:中国莲(N.nucifera)和美国莲(N.lutea.Pers.)。中国是荷花的世界分布中心,也是其栽培中心。据统计,目前中国的荷花品种数多达1000份。为了了解中国荷花品种的遗传信息,本试验应用形态学标记和SSR标记两种方法,对来自中国荷花研究中心荷花种质资源圃的319个荷花品种进行遗传多样性的分析,旨在更好地对我国荷花种质资源进行分类、贮存和利用。主要研究结果如下:(1)对319个荷花材料11个表型性状进行数据调查分析,结果显示:“花瓣数”的变异系数最大为69%,株型相关性状变异系数都在20%左右;表型性状之间的相关系数在0.395~0.979之间,株型相关性状之间呈极显著相关关系;以欧氏距离及非加权配对算术平均法(UPGMA)对供试样品进行聚类,在遗传距离为5.4时,将319份材料分成了五个组,在遗传距离为4.1时,又将第Ⅰ组分为四个亚组。(2)从200对SSR引物中筛选出93对多态引物对供试样品进行SSR-PCR扩增,共检测出350个观测等位基因,毎个位点观测等位基因数(Na)为2~9个,平均每个位点3.76个;有效等位基因数(Ne)在1.1297~6.0288之间,平均2.227;Shannon’s信息指数(I)在0.2301~1.8708之间,平均0.8717;观测杂合度(Ho)在0.047~0.6583之间,平均0.3892;期望杂合度(He)在0.115~0.8363之间,平均0.5109;基因多样性指数(H)在0.1148~0.8350之间,平均0.5101;多态性信息含量(PIC)在0.1082~0.8139,平均0.4367。(3)使用NTSYS-pc2.10e软件对SSR标记数据进行分析,结果表明:品种间遗传相似系数绝大部分处在0.422~0.997之间;采用非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类结果表明,在相似系数为0.67时,319个材料被分成3个组,其中第Ⅰ组包括了295个样品;在阈值为0.72时,第Ⅰ组又分成了7个亚组。(4)形态学标记的结果和SSR标记的结果具有一定程度上的相符性,且都能反映出荷花丰富的遗传多样性,均适用于荷花遗传多样性的研究。