新疆地区有遗传风险的乳腺癌患者相关易感基因BRCA1/2、BRIP1、PALB2、CHEK2的研究

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目的:(1)通过对新疆地区具有遗传背景的乳腺癌患者进行BRCA1/2基因突变检测,了解BRCA1/2基因的突变情况及在人群中的分布,探讨BRCA1/2基因致病性突变与遗传性乳腺癌的关系。(2)通过对BRCA1/2基因突变患者临床及病理特征分析,利用Logistic回归分析建立新疆地区有遗传易感性乳腺癌患者BRCA突变风险的模型。(3)通过对BRCA1/2突变阴性的乳腺癌患者进行PALB2、BRIP1、CHEK2基因突变检测,了解这3个基因在有遗传背景的乳腺癌患者突变及分布情况,探讨其与遗传性乳腺癌的关系。方法:(1)选取214例具有遗传风险乳腺癌患者为研究对象,选择同期100例健康体检者作为对照组,抽外周静脉血5ml,提取基因组DNA并进行扩增,对BRCA1/2基因的全部外显子、外显子与内含子连接区以及剪切点序列进行突变检测,采用变性高效液相色谱分析(PCR-DHPLC)进行检测,突变的结果进行DNA测序证实。(2)分析影响这些患者BRCA1/2基因突变相关影响因素,其中164例患者的信息作为突变风险预测的样本,利用Logistic回归建立BRCA1/2基因突变风险预测模型,用另外50例患者验证该模型,并与现有的BRCApro和BOADICEA模型进行比较。(3)选取BRCA1/2突变阴性的112例为研究对象,对照组同第一部分,通过外周静脉血提取基因组DNA并进行扩增,采用相同的方法对BRIP1、PALB2、CHEK2基因的全部外显子、外显子与内含子连接区以及剪切点序列进行突变检测。结果:(1)214例患者BRCA1/2基因总的突变检出率为16.8%(36/214),其中BRCA1为9.8%,BRCA2为7.0%。有乳腺癌/卵巢癌家族史患者98例,BRCA1/2基因总的突变检出率为20.4%(其中BRCA19.2%,BRCA211.2%);双乳癌36例,BRCA1/2突变率26.3%(其中BRCA1突变率13.2%,BRCA2突变率2.6%),高于单侧乳腺癌患者的突变率14.6%(P=0.054);88例三阴性乳腺癌BRCA1/2突变率为28.4%(其中BRCA1突变率20.4%,BRCA2突变率8.0%),高于非三阴性乳腺癌突变率8.7%(P<0.05);汉族与其他民族的突变检出率分别为14.2%、20.9%,差异无统计学意义。在研究中未发现有突变热点,突变遍布整条基因,但是有一半以上突变在外显子10和11。同时在139例患者的检测中发现43个致病意义不明的突变位点,其中BRCA1突变位点21个,BRCA2突变位点22个。(2)影响有遗传风险的乳腺癌患者BRCA1/2突变的因素为:家族中乳腺癌发病最低年龄,是否有卵巢癌家族史,家族中乳腺癌患病人数,双侧原发性乳腺癌及三阴性乳腺癌。多因素分析显示,家族中乳腺癌发病最轻年龄每增加1岁,BRCA1/2突变风险降低11%,家族中乳腺癌患病人数每增加1人,BRCA1/2突变风险增加1.781倍,有卵巢癌家族史、双侧原发性乳腺癌及三阴性乳腺癌患者BRCA1/2突变的风险也都明显增加。将本研究建立的模型与BRCApro及BOADICEA模型进行比较,敏感性分别为1.0、0.5、0.5,特异性分别为0.771、0.812、0.833,阴性预测值分别为1.0、0.975、0.976,曲线下面积分别为0.885、0.656、0.667。(3)112例BRCA1/2突变阴性的乳腺癌患者,行PALB2、BRIP1和CHEK2基因突变筛查,突变率分别为2.7%、1.8%和0%。PALB2基因突变为3294delTCGTC的缺失移码突变、1039insA插入移码突变和2386G>T无义突变,BRIP1基因为1795G>A剪切位点突变。其中PALB2基因1039insA移码突变、BRIP1基因1795G>A剪切位点突变为新发现的突变,与乳腺癌发病风险相关,可能是中国人群特有突变。PALB2基因突变的患者和BRCA1/2突变乳腺癌患者具有类似的病理学特征。在本研究中未检测到CHEK2基因致病性突变。结论:(1)在新疆多民族地区有高突变风险的乳腺癌患者进行BRCA1/2基因突变检测是可行的。尤其对于有卵巢癌家族史或三阴性乳腺癌推荐进行该基因的筛查。根据突变的特点建议首先进行热点片段的检测,阴性者再进行全基因的检测,对于三阴性乳腺癌或双侧原发性乳腺癌患者先进行BRCA1检测,可能会提高检测效率、降低检测成本。(2)因中国的人群具有不同于其它种族人群的BRCA突变特征,根据自身遗传特点建立的模型可用于具有遗传易感性乳腺癌患者BRCA基因突变风险评估,且优于已有的BRCApro及BOADICEA模型。(3)PALB2、BRIP1基因突变增加了乳腺癌的发病风险,对BRCA1/2突变阴性的乳腺癌建议继续进行PALB2、BRIP1基因突变检测。
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