绩效审计作为一种政府经济控制手段,以经济性、效率性、效果性为原则,来强化政府的经济责任,促进经济增长、劳动就业等目标的实现,以及资源的合理配置和有效利用,实现经济、节约、效率,取得最佳社会效益和经济效益。但绩效审计是一项内容复杂、政策性和专业性都很强的工作,不同领域都有不同的评价指标、评价方法和评价标准,目前还没有形成一套完整的绩效审计理论体系和方法体系。本研究选取了财政支出的一个重要组成部分——高等教育经费的绩效审计作为研究对象,尝试建立起一套科学、合理、操作性强的高等教育经费绩效审计评价体系,以助于完善对资金配置与使用过程的有效监督和控制,提高和促进高等教育经费的管理水平和使用效益。论文以“高等教育经费政府绩效审计体系研究”为选题,结合高等教育经费管理的现实需要,采用规范分析与实证分析、定性分析与定量分析相结合的研究方法,逐层展开,构建了我国高等教育经费政府绩效审计体系。论文从分析国内外政府绩效审计理论研究和实践开展情况入手,对之发展共性进行分析,根据高等教育经费绩效的层次性,结合实际工作开展的需要,构建了高等教育经费(分区域)综合绩效、经费使用单位-高等学校绩效、专项项目绩效三个层次的绩效审计体系,从宏观、中观、微观三个层面进行分析。运用回归分析、DEA方法对高等教育经费(分区域)的综合绩效审计进行研究,建立了高等教育投入对经济增长贡献额的回归模型,及高等教育经费(分区域)综合绩效DEA评价模型。运用平衡记分卡原理构建高等学校绩效审计内容及审计评价指标体系,提出确定高等学校绩效审计评价标准的方法,探索高等学校经费绩效审计评价的具体步骤与方法。结合案例分析,构建高等教育经费专项项目绩效审计层面具体的审计内容及评价方法。论文最后,提出了高等教育经费政府绩效审计的质量控制的几点建议,以保证审计质量。