小麦品质性状—沉淀值的全基因组关联分析

来源 :河南科技学院 | 被引量 : 1次 | 上传用户:baiqing001
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小麦是我国重要的主粮之一,沉淀值作为小麦品质性状组成之一,对小麦育种和食品加工有重要影响。沉淀值是评价小麦面筋含量重要指标之一,与面包体积和面团形成、稳定时间等有密切关系。因此,对小麦沉淀值及其遗传规律进行研究,对于小麦育种和品质改良有着重要意义。本文利用660K基因芯片基因分型,通过收集的493份小麦核心种质材料进行沉淀值的全基因组关联分析,通过2年时间3个地区5个环境下种植与面粉沉淀值测定,利用全基因组关联分析解析沉淀值遗传控制机理。主要研究结果如下:(1)参试材料属于自然群体,群体结构分析表明,本研究所用材料适合做全基因组关联分析,材料间亲缘关系较远,只有43份材亲缘关系较近,符合全基因组关联分析材料约占总材料的92%,对结果准确性和可信度奠定基础。(2)小麦沉淀值特性在参加试验的493份材料间的变异较广泛,且频率分布成正态分布,少部分材料在5个环境下沉淀值较大,如陕优225等。山东(SD)和陕西(SX)环境下,小麦品质较其他3个环境明显提高,SX环境沉淀值变异最大,其他环境下基本一致。(3)全基因组关联分析中发现在1A、1B、1D、6A、7D染色体上都检测到强遗传效应SNP遗传位点192个,如:AX94929872、AX86180188、AX94876256、AX110052107、AX110459663、AX111793464、AX108747296、AX108912374等,其中AX108912374在不同分析条件下多次出现。这些位点与小麦品质关键基因如高分子量麦谷蛋白、低分子量麦谷蛋白和醇溶蛋白基因重合,是品质基因重要的遗传位点。(4)对表型数据标准化处理并采用Tassel5.0进行缺失数据预测填补后采用混合线性模型进行关联分析得出的SNP位点进行优异等位变异分析发现,在两个及以上的环境中均能检测到的与沉淀值关联稳定的位点有6个,分别为AX108747296-A、AX94877770-T、AX110052107-G、AX111793464-C、AX94876256-T、AX94929872-A,分别提高沉淀值1.87mL、2.10mL、1.99mL、1.98mL、2.05mL、2.02mL。本研究检测到的SNP位点为小麦在分子水平上进行辅助选择育种和品质改良提供了理论依据,为挖掘开发控制小麦品质特性的功能基因奠定基础。
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