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母猪产仔数是反映猪场生产水平和经济效应的重要指标，并直接影响我国节粮、减排、高效养猪业的可持续发展。产仔数为复杂多基因控制的经济性状，遗传力低，通过传统的选育方法提高猪产仔数收效甚微，所以开发和利用新的分子选育标记来提高猪的繁殖性能倍受重视。本实验室与中国科学院昆明动物研究所进行的合作中利用高通量重测序技术筛选到1917个二花脸猪的特异性选择区域，通过对10个二花脸猪个体及50个中国地方猪种的个体进行全基因组重测序，利用选择性清除（selectivesweep）的方法对测序结果进行分析，筛选和鉴别出二花脸猪特异的选择性清除位点。在此基础上，本研究采集了实验室资源家系F2代群体242个个体394组繁殖记录，苏太猪群体200个个体1020组繁殖记录，以及西方商业猪种大白猪群体446个个体1539组繁殖记录和长大二元杂群体424个个体1678组繁殖记录，分别选用了其中的192个个体315组繁殖记录，190个个体1009组繁殖记录以及408个个体1426组繁殖记录和409个个体1629组繁殖记录，进行关联性分析。并且对二花脸猪特异的选择性清除位点进行分析，挑选了分布于18条常染色体中的144个特异性选择位点，利用SnapShot分型法对这些位点在192个资源家系F2代群体个体进行分型，分析这些位点与母猪产仔数性状的相关性，结果显示其中10个区域中的12个位点与产仔数显著相关，有4个与产仔数相关性极显著。为了验证上述显著位点对产仔数的影响效应，本研究在190个苏太猪群体个体中利用SnapShot分型法和高分辨率溶解曲线(HRM)对61个SNP位点，覆盖了9个资源家系F2群体结果显著位点区域，进行基因分型，并且进行了SNP基因型与产仔数表型的关联性分析。结果显示，有6个区域6个位点显著影响产仔数表型，其中4个位点达到极显著水平。为了进一步判别这些显著位点是否具有广泛的商业应用价值，本研究重新设计了12对引物，利用SnapShot分型法对409个大白母猪个体和424个长大二元杂母猪个体进行基因分型，对分型结果与表型进行关联分析。结果显示在大白母猪群体中有4个位点与产仔数性状显著关联，其中3个位点达到极显著水平，在长大二元杂母猪群体中3个位点与产仔数性状显著关联，其中2个位点达到极显著水平。位于3号和6号染色体上的2个位点在大白猪群和长大猪群里均达到显著水平。本研究通过选取二花脸猪特异性的选择位点，在4个母猪群体中筛选出了影响猪产仔数的显著效应位点，为鉴别和筛选影响猪产仔数的功能基因奠定了基础，以及为揭示猪高产仔数的遗传机理提供科学依据。本研究同时可为将来建立猪产仔数的新型高效育种技术提供技术支持，为发展节粮型生猪产业提供重要理论基础和参考，从而促进我国高产节粮型生猪产业的发展。