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淋巴细胞主要包括B细胞和T细胞,由共同淋巴祖母细胞(common lymphoid progenitors,CLP)经历多个连续、特征性阶段发育而来,其成熟过程与淋巴瘤和淋巴细胞白血病等血液疾病相关。许多转录因子(transcription factors,TFs)和micro RNAs(miRN As)已被发现参与淋巴细胞发育过程,但两者的共调控机制尚不清楚。本项目充分整理已有的数据,尝试从转录因子和miRNA共调控角度去理解淋巴细胞发育过程。首先,本项目通过搜索已有的文献和相关数据库,获得B/T细胞成熟过程各个阶段的候选基因、miRNA和转录因子,然后利用多种生物信息学手段构建了每个阶段的转录因子-miRNA-基因前馈环(Feed forward loop,FFL),并设计置换检验模型检验前馈环,统计检验显示我们的前馈环与随机生成的相比具有明显的统计显著性,它们是在该过程富集并且有意义的。进一步分别整合各过程的所有前馈环构造了其转录因子-miRNA共调控网络。最后,通过比较分析B细胞和T细胞成熟各阶段中的网络和前馈环,找出了其中的关键调控因子,例如:MYC,STAT5A,PAX5和miR-17~92是祖B细胞向前B细胞转变过程的核心元件;RUNX3和NANOG决定着CD4/CD8系统。本项目还鉴定了一些分别在B细胞成熟网络和T细胞网络中多次出现的调控模块,如B系统中的miR-146a/NFKB1/BCL11A和T系统中的miR-20/CCND2/SORL1。另外还找出了B细胞和T细胞早期发育过程中共有的调控因子和模块,如STAT5A/miR-20a/CCND2。结论:构造转录因子-miRNA共调控网络是识别生物过程和疾病中的关键调控因子和模块的可行方法。本研究可以加强对B细胞发育和T细胞发育过程以及相关血液疾病的理解。