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目的：利用遗传统计学方法鉴定骨质疏松症风险基因对于探索骨质疏松症的发病机制,进而推动该病的有效防治具有重要意义。为了明确MATN3,GPR98, ADIPOR1及PLIN1基因与骨质疏松症之间的关系,本研究在大样本中国人群和美国高加索人群进行了MATN3, GPR98, ADIPOR1及PLIN1基因的多态性与人群骨密度之间的遗传关联分析。方法：本研究涉及到五个不同的研究人群,其中美国奥马哈骨质疏松症研究(OOS),美国堪萨斯城骨质疏松症研究(KCOS),中国汉族骨质疏松症研究(COS)是本课题组直接开展的三个研究；美国弗雷明汉心脏病研究(FHS),印第安纳州脆性骨病研究(IFS)的基因型与表型数据是来自公共数据库(dbGAP)的共享资源,这五个人群的腰椎(SPN)和全髋(HIP)骨密度均通过双能X射线吸收仪进行检测,同时亦采集有完整的身高、体重等身体测量数据,基因型数据均来自全基因组分型芯片实验。遗传关联分析采用加性遗传模型。对四个美国高加索人群(OOS, KCOS, FHS, IFS)进一步进行了关联分析的Meta分析。结果：MATN3的单核苷酸多态性与中国人群BMD的关联主要体现在腰椎部位,有6个SNP(rs11689431,rs11674251,rs6734005,rs3731667,rs16987297,rs2244939)通过了多重检验校正(P<0.0033,3.35×10-5～0.003),其中两个SNP (rs11689431, rs11674251)与BMD的关联P值很低(P值分别为3.77×10-5和3.35×10-5),在美国人群的Meta分析中,MATN3基因区未发现与腰椎或全髋骨密度显著关联的SNP (Meta P均>0.05)。在中国人群,GPR98基因的SNP rs7733007与腰椎BMD的关联P值低于0.05(P=0.041)。在美国人群的Meta分析中,SNP rs12658994与髋部BMD的Meta P<0.05(Meta P=0.01),在腰椎部位则有4个SNP(rs6873773, rs13176728,rs13163651, rs10514345)与BMD的Meta P<0.05(0.01-0.027)。 ADIPOR1基因和PLIN1基因在中国人群和美国人群均未见与BMD关联显著的SNP。结论：研究提示MATN3多态性在中国人群对BMD可能有重要影响,而在美国人群可能并不是BMD的重要影响因素：本研究对GPR98在中国汉族人群和美国高加索人群骨密度的关联具有提示和支持作用；ADIPOR1和PLIN1在中国人群和美国人群与人群骨密度变异无关联。