玉米抗倒伏相关性状Meta-QTL及候选基因分析

来源 :延边大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wskiqpk
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
倒伏是影响玉米产量和品质的一个重要因素。玉米倒伏不仅会对植株的输导组织产生影响,还会在空间上改变植株整体叶片分布,降低叶片的光合作用效率;茎秆倒伏发生部位还极易引起病虫害的感染,加剧玉米产量和茎秆质量的降低。抗倒伏性状是一个复杂的数量性状,随着分子标记技术的快速发展,大量玉米抗倒伏相关QTL被定位出来,但由于不同研究者所用的定位群体不同、群体大小和作图密度普遍较小等原因,很难找到与玉米抗倒伏紧密连锁的分子标记,能够应用于育种过程的有效标记较少。元分析技术可以在整合不同来源QTL的基础上,获得更为准确的连锁标记位点,对玉米抗倒伏育种具有一定辅助作用。本文在收集玉米抗倒伏相关性状QTL的基础上,对基于不同分子标记定位的QTL分别整合到IBM MaizeSNP50参考图谱和IBM2 2008 Neighbors参考图谱上;通过元分析技术和水稻同源性对比来挖掘玉米抗倒伏相关候选基因。主要结果如下:1.共收集到128篇与玉米抗倒伏相关性状的QTL定位文章,涉及164个定位群体,共2381个抗倒伏相关性状QTL。有1610个抗倒伏相关性状QTL映射到IBM2 2008Neighbors图谱上,经元分析分别得到90个株型相关、42个茎秆相关、39个根系相关、73个抗病虫害相关性状Meta-QTL。有771个抗倒伏相关性状QTL映射到IBM MaizeSNP50参考图谱上,经元分析分别得到82个株型相关、51个茎秆相关、43个根系相关性状Meta-QTL。不同相关性状Meta-QTL在不同染色体上分布的位置较为集中,且置信区间的重叠区域较为密集。2.两张参考图谱上株型相关、茎秆相关、根系相关性状Meta-QTL区域内共同包含的基因分别有909、1769、865个。映射到IBM2 2008 Neighbors参考图谱上抗病虫害相关性状Meta-QTL与基于第三代分子标记技术定位的23个QTL区域内共同包含的基因有2359个。3.对四个相关性状共同包含的基因分别进行功能分析发现,株型相关性状共同基因主要涉及维持植株正常生长发育及代谢调控的泛素连接酶复合物和油菜素内酯代谢通路;茎秆相关性状共同基因主要涉及纤维素合成和抗病虫害相关的糖类合成、丙酸代谢通路、次生代谢产物等过程;根系相关性状共同基因主要涉及胞内、细胞器、鞘脂代谢等细胞形成发育过程;抗病虫害相关性状共同基因主要涉及抗病虫害物质合成,包括萜烯合酶活性、萜类化合物和次生代谢产物的形成等过程。GO富集分析和Pathway富集分析进一步明确了相关性状共同基因在玉米抗倒伏过程中发挥的功能及参与的代谢通路。4.共收集到水稻已克隆的抗倒伏相关基因141个、玉米根系抗倒伏候选基因3个。利用NCBI网站将水稻已克隆抗倒伏相关基因与玉米基因组进行同源性对比,在两张参考图谱的四个相同的相关性状共同基因内挖掘出27个玉米同源抗倒伏候选基因,在IBM22008Neighbors参考图谱四个相关性状共同基因内挖掘出1个玉米抗倒伏候选基因。
其他文献
进入新世纪,伴随着经济的快速发展和人们生活的显著提高,猪肉的消费需求量也越来越多,从以往仅是要求数量上的满足逐渐朝着质量要求上转变。但是,消费者对市场上的猪肉安全的
由于全球对液态烃燃料的需求不断增长,通过费托合成(Fischer-Tropsch Synthesis,缩写FTS)将含碳资源衍生的合成气(CO+H2)催化转化为清洁燃料和有价值的化学品具有重要的经济意义
目的:本实验研究通过建立大鼠子宫韧带机械性损伤模型,利用子宫内膜间充质干细胞的多向分化潜能,使损伤的韧带组织进行再生修复,检测在修复前后韧带中弹性蛋白表达的情况,初步探讨干细胞在韧带组织损伤修复过程中的部分再生或完全再生功能。方法:选择体重为300±10g的清洁级SD雌性大鼠建立第一次普通大鼠子宫韧带机械性损伤模型,分别取术后3天、6天、9天、12天、15天以及正常的大鼠子宫韧带,每组取材后将组织
在安溪云中山自然保护区南岭栲天然林群落中设置样地,应用混交度、大小比数、角尺度3个结构参数对南岭栲天然林群落林分空间结构特征进行分析,结果表明:南岭栲在该群落乔木层
目的 通过对笔者医院血友病中心近年来儿童血友病患者的登记和管理数据进行回顾性分析,以总结经验、提高对血友病登记和管理的认识,为进一步制定符合中国国情的儿童血友病综
旋转机械作为机械设备故障的主要类型之一,其故障信号检测对机械设备状态的监测具有重要意义。本文针对强噪声下滚动轴承故障信号难以检测的问题,采用基于时延随机共振和变分模态分解的方法,对故障信号进行降噪处理和特征提取,并用粒子群优化的最小二乘支持向量机对故障信号的类型进行模式识别。具体内容如下:本文研究了一般多稳态随机共振模型的郎之万方程,推导了带有时延项的福克-普朗克方程,并使用四阶龙格-库塔方程对随
能源危机与环境污染是当今世界的热议话题。新能源与可再生能源的开发和利用是世界各国的研究重点。其中,氢能以清洁、高效、可再生的优点备受各国关注。本文以葡萄糖为原料,
抽油机是油田采油的主要生产设备,当前我国油田作业领域的主力军依然是游梁式抽油机。但随着油田开采,我国稠油开采的环境特点促使抽油机朝着长冲程、大载荷、节能性好、冲程
在电影当中,原声音乐的融入是至关重要的。电影原声音乐是电影的重要组成部分,同时也是电影剧情推进节奏的决定性因素。利用音乐对影片进行推动,不仅可以使得观众的情感伴随
随着计算机辅助医疗技术的发展,医学X光图像分析逐渐成为生物医学领域的研究热点。椎体部分作为腰椎X光图像的感兴趣区域,从腰椎图像中提取椎体的信息对于腰椎疾病的诊断具有