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本文旨在寻找不同来源的SARS相关冠状病毒的遗传变异规律；探讨SARS的可能传播途径，结果表明，SARS-CoV基因组变异频率较高，变异位点在基因组中呈偏态分布，SARS基因组序列后三分之一(19-29kb)的10kb范围内即结构蛋白编码区，突变频率较高。突变频率最大的区域位于基因组的25.1-26.8kb，其次为基因组的22.0-24.0kb区域。前者编码ORF3、ORF4、E蛋白和M蛋白，后者位于编码S蛋白的阅读框内；推测中国大陆可能有两条SARS传播途径：一是从广东为原始病原暴发地向国内其它地区流行，另一条是通过索引患者经香港M宾馆传到世界各地，后回输到北京乃至大陆其它地区。