长江三角洲是我国经济最发达的地区之一，也是区域经济一体化最深入的地区，三省市联系日益紧密。太湖流域作为长三角的中心地带，水污染却成为制约地方经济与社会发展的重要因素。2007年发生了太湖蓝藻事件，而今年（2013年）又发生了黄浦江死猪事件。这些环境事件都引起了民众的恐慌，也增加了民众对政府的不信任感。水是生命之源。以牺牲环境资源的代价换来发展是错误的，必须走可持续发展的道路。太湖流域的环境保护相对全国其他地区有其特点。本文通过收集各种资料，总结太湖流域治理的现状，吸取我国其他主要湖泊治理时候得到的经验教训，并且分析现在存在的一些立法执法还有制度方面的问题。为了找出这些问题的对策，我们参考了其他国家的一些治理湖泊的成功案例。通过运用科学发展观的原理，从立法、执法还有司法保障三个方面提出相应的解决方法。在这过程中，我们对于湖泊污染治理责任缺位的问题给予了较大的关注，治理湖泊水体的污染，流域沿岸三省市的各级地方政府负有主要责任。各级地方政府在领导责任制的落实方面还有很大的问题。我们也缺乏相关的合理的规章制度，对于相对人权利的保护也非常欠缺。生态文明是我国新提出来的，要建设生态文明，中国涉及环保的行政机构不能再无作为。太湖流域最大的特点是经济比我国其他地区发达，但污染时间也较长，污染更严重。最大的问题就是三省市治水，拥有立法权主体多。解决这些问题，首先要统一和理顺各项法律法规，其次要协作执法、加强执法，突出流域的整体管理，弱化各个行政区域的管理，第三要让民众参与进来，同时完善司法制度。