花尾榛鸡(Tetrastes bonasia)是松鸡科鸟类中分布最广、最为常见的一个种。花尾榛鸡的分类地位一直存在争议，目前，从分子水平上专门对花尾榛鸡系统地位的研究还未见报道。花尾榛鸡由于肉味鲜美深得人们青睐，因野生数量减少已被列为国家二级保护动物，但其人工驯养繁殖中存在繁殖率低、幼雏成活率低和对疾病的易感性等问题，而MHC基因与抗病性和繁殖力都有很大的相关性，因此，对花尾榛鸡BLB基因多态性进行研究必要而可行。　　本研究首先通过实验获得花尾榛鸡和黑琴鸡的COⅠ序列，并从Genbank中下载松鸡科17个物种的12S rRNA、Cytb、ND2序列和13个物种的COⅠ序列，通过单基因和多基因整合序列从分子水平探讨花尾榛鸡的系统地位。其次，对花尾榛鸡33个个体BLB基因的exon2进行PCR扩增，采用克隆测序的方法进行序列测定，并利用生物软件对所获得的核苷酸序列进行分析，结果如下:　　1、依据12S rRNA、Cytb和COⅠ基因序列和四个基因的整合序列的系统发育分析结果，本研究支持将花尾榛鸡划入松鸡科(Tetraonidae)榛鸡属(Tetrastes)，即支持Tetrastes属有效。　　2、对比单基因和整合数据的结果，所选择的4个基因中，COⅠ基因更适合松鸡科鸟类的系统发生关系研究。　　3、从33个个体中得到234条克隆序列，比对分析后得到13个等位基因序列。核苷酸突变分析表明，花尾榛鸡13个BLB等位基因的突变主要以颠换为主。平均非同义替换率dn(0.111)与平均同义替换率ds(0.096)的比值为1.156，大于1，表现为正向选择。　　4、利用BLB外显子2序列对花尾榛鸡种群进行遗传多样性分析，结果显示，该种群的遗传多样性偏低，暗示该物种的抗病能力较弱。　　5、根据进化树、Network网络图以及个体基因型显示，花尾榛鸡可能存在至少3个BLB座位;在鸟类MHC的BLB中存在着基因重复事件。　　6、构建的鸡形目10种鸟类的BLB进化树显示，所分析雉科中红腹锦鸡和环颈雉的BLB与松鸡科鸟类BLB的进化关系较近;BLB在鸡形目鸟类科间及科内都存在跨物种进化现象。