知识产权保护是一个在发达国家与发展中国家之间存在巨大利益差异的领域，乌拉圭回合首次在多边贸易体制内触及了这一领域，并最终达成了集大成式的具有高保护水准和约束力的TRIPS协议。而该协议的达成本身是各个成员，尤其是发达成员和发展中成员利益的折衷的结果。协议中对专利的保护，尤其在对药品专利的保护上，就是这一问题的体现。而对于药品专利是否要实施专利保护则是在各成员方中最富有争议的问题。因为，一方面药品造价昂贵，需要有专利的手段来促进医药行业的研究和发展；而另一方面，当前各种危害人类健康的疾病流行，需要大量的廉价药物来防止和治疗疾病。尤其在广大发展中国家中，对药品具有相当大的需求。因此，是否对药品要实施专利保护问题成为各国所关心的问题。特别是在911恐怖袭击之后，以美国为代表的发达国家也开始遭受恐怖分子实施的炭蛆等病毒细菌的袭击，因此对这一危害人类公共健康的问题又再次引起了关注，并开始讨论是否要对药品实施专利保护的问题。而在WTO的框架下，TRIPS协议对药品专利实施的保护显然就存在一些问题，引起了全球的关注。本文正是抓住了这一热点问题，试图通过理论与实际相结合的方法，通过对TRIPS协议下对药品专利实施的保护以及存在的问题进行理论分析，同时结合发生在发展中国家的印度药品和农业化学品专利保护案和发生在发达国家中的加拿大药品专利保护案的案例进行实证分析，来透视WTO中TRIPS协议的内涵以及其中存在的一些问题，以期进一步加深对TRIPS协议下对药品专利的保护的认识，为我国对药品专利保护的实施以及进行TRIPS 协议的谈判以及我国自己政策的制定提供一些务实而又可操作的对策和思路。文章共分五部分。引言部分首先对专利制度以及有关TRIPS对专利保护做一介绍，来阐述文章之主旨。正文的的第一部分标题为“TRIPS对药品专利保护的理论研究”。 该部分从“TRIPS协议下对专利及药品专利保护的介绍”、“TRIPS协议下对药品专利保护中存在的问题”以及“TRIPS协议中对药品的专利保护中的利益平衡”三个方面来展开理论分析，说明TRIPS下对药品专利的保护的达成实际上是各国利益妥协的一个结果，同时指出了当前热点的问题，即公共健康权与专利权相冲突的问题以及WTO围绕这一问题的处理措施。同时，也从法理角度对这一冲突的平衡进行了分析，希<WP=5>望能在理论上对该问题有一个详细的阐述。正文的第二部分标题为“TRIPS对药品专利保护的实证研究”。 该部分主要通过介绍两个具有代表意义的案例，一个是发生在发展中国家的印度药品和农业化学品专利保护案，另一个是发生在发达国家中的加拿大药品专利保护案，来透视TRIPS协议中存在的问题以及对通过案例中反映出来的问题来对这些问题展开思考。该部分主要有“两则药品专利保护案”、“从案例透视TRIPS对专利保护问题及引发的思考”两个问题，指出TRIPS中对药品专利的保护实际上是发达国家和发展中国家利益折中的产物同时也指出TRIPS协议中对药品专利保护中所暗含的发达国家为保护自己利益所设计的精巧平衡。正文的第三部分标题为“中国的应对策略”。该部分主要在以上第一和第二部分中进行的分析的基础上，分析了中国在加入WTO后为了遵循TRIPS协议而对专利法进行的修改，并且阐述了中国对药品专利保护所采取的措施，并对中国今后在药品专利的保护领域提出了一些建议和设想。同时，本部分还从分析TRIPS协议中与本案例的中涉及的有关条款出发，来对中国今后参与到WTO谈判中来应当采取的措施提出了建议。结语部分再次重申了专利制度的出现所产生的影响以及在TRIPS协议中对专利保护所达成的条款的实质所在，并提出药品专利保护和公共健康权相冲突这一问题，以期望能在此引起有所重视。